RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa10.75□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa10.75□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.75□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ALKQ9UM73 1620 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 DDX58O95786 925 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 RAB3GAP1Q15042 981 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 MCM10Q7L590 875 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ACEP12821 1306 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 PIK3R4Q99570 1358 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 DCTN1Q14203 1278 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 USP19O94966 1318 aa10.73□□□□□ -0.69
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HERC3-201ENST00000264345 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.73□□□□□ -0.69
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HERC3-201ENST00000264345 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 HIP1O00291 1037 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 TSPYL6Q8N831 410 aa10.73□□□□□ -0.69
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HERC3-201ENST00000264345 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
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HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF10O15013 1369 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 FLT4P35916 1363 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 FAM83GA6ND36 823 aa10.72□□□□□ -0.69
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HERC3-201ENST00000264345 MX1P20591 662 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ABTB2Q8N961 1025 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ADGRB2O60241 1585 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ZNF853P0CG23 659 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 KLHL40Q2TBA0 621 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 CHL1O00533 1208 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 TPM2P07951 284 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ANTXR1Q9H6X2 564 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 RNF20Q5VTR2 975 aa10.71□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 CEP85Q6P2H3 762 aa10.71□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 FGD1P98174 961 aa10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 PSME1Q06323 249 aa10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 NEXNQ0ZGT2 675 aa10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 ANAPC15P60006 121 aa10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 SMC3Q9UQE7 1217 aa10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 BAG4O95429 457 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 SSFA2P28290 1259 aa10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 ESPNB1AK53 854 aa10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 NECTIN2Q92692 538 aa10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 KIF3AQ9Y496 699 aa10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 SBNO1A3KN83 1393 aa10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 SDSP20132 328 aa10.69□□□□□ -0.7
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HERC3-201ENST00000264345 KCNH5Q8NCM2 988 aa10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 SHPRHQ149N8 1683 aa10.69□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 FBLN1P23142 703 aa10.69□□□□□ -0.7
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HERC3-201ENST00000264345 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 TSPY26PQ9H489 355 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 USP26Q9BXU7 913 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 ATP8B2P98198 1209 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 AGLP35573 1532 aa10.67□□□□□ -0.7
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