RNA–Protein interactions for RNA: YOR248W

YOR248W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YOR248W, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR248W	YOR248W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	CDC55	Q00362	526 aa		5	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	MEC3	Q02574	474 aa		5	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	NSI1	Q12457	570 aa		5	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	SAP155	P43612	1002 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	NUT1	P53114	1132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	DFG16	Q99234	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	ERP5	P38819	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	MDJ2	P42834	146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	MON1	P53129	644 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	YAF9	P53930	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	EAR1	Q03212	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	PMT7	Q06644	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	FRT1	Q99332	602 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOR248W	YOR248W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	ECL1	P48235	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	HSP78	P33416	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	UBP5	P39944	805 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	ALT1	P52893	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	YGR045C	P53229	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	NUT2	Q06213	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	HAT1	Q12341	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	NFS1	P25374	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	YVC1	Q12324	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	ADP1	P25371	1049 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	EXO5	P38289	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	NIT1	P40447	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	SLS1	P42900	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	SSY1	Q03770	852 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	TRE1	Q08919	783 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	YKL077W	P36081	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	GEF1	P37020	779 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR248W	YOR248W	PEX7	P39108	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	SAM37	P50110	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	PRO1	P32264	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	NNK1	P36003	928 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	NEM1	P38757	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	CDA2	Q06703	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	PTC7	P38797	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	SHU2	P38957	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	ORC3	P54790	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	TPP1	Q03796	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	YAR028W	P39548	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	GTS1	P40956	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	MSH3	P25336	1018 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	UGA4	P32837	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	YHL050C	P38721	697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	YHR219W	P38900	624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	PEX13	P80667	386 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR248W	YOR248W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	ESC8	Q08119	714 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	YKL222C	P35995	705 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	XKS1	P42826	600 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	RSM26	P47141	266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	DAL4	Q04895	635 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	YCR015C	P25616	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	THI80	P35202	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOR248W	YOR248W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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