RNA–Protein interactions for RNA: YOR163W

DDP1, Transcript of Polyphosphate phosphatase, yeast

Gene DDP1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDP1	YOR163W	YOR223W	Q12015	292 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	RPB10	P22139	70 aa		5	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	YCR015C	P25616	317 aa		5	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	SMC1	P32908	1225 aa		5	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	PSY2	P40164	858 aa		5	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	CIT3	P43635	486 aa		5	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	VPS72	Q03388	795 aa		5	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		5	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	RNH70	P53331	553 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	NSI1	Q12457	570 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	ATE1	P16639	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	SEC20	P28791	383 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	GPT2	P36148	743 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	YHL008C	P38750	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	ERP5	P38819	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	POL32	P47110	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	UBX5	Q06682	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDP1	YOR163W	HSP78	P33416	811 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	YKL222C	P35995	705 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
DDP1	YOR163W	TPO2	P53283	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	RCM1	P53972	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	CDA2	Q06703	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	TSR4	P25040	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	PPG1	P32838	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	OSW7	P43611	510 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	GCV1	P48015	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	ESC8	Q08119	714 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	TOM20	P35180	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	YHL050C	P38721	697 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	YHR219W	P38900	624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	CTR9	P89105	1077 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	YIG1	Q08956	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	SEC8	P32855	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	THI12	P42883	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	THI5	P43534	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	THI11	P47183	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	SVF1	Q05515	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	THI13	Q07748	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	TAF1	P46677	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	MDG1	P53885	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	ORC3	P54790	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	WHI5	Q12416	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDP1	YOR163W	COB	P00163	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	THI80	P35202	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	RIM11	P38615	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	BOL3	P39724	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	VAC8	P39968	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	KAR5	Q04746	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	NPR1	P22211	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	ADP1	P25371	1049 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	GIP4	P39732	760 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	ALT1	P52893	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	CIT2	P08679	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	MDJ2	P42834	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	ALG12	P53730	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	MEC3	Q02574	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	IOC3	P43596	787 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	SSY1	Q03770	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	TRE1	Q08919	783 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	DUR3	P33413	735 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	PPX1	P38698	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	PEX7	P39108	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	RSC4	Q02206	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	EAR1	Q03212	550 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	YVC1	Q12324	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDP1	YOR163W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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