RNA–Protein interactions for RNA: YMR063W

RIM9, Transcript of Plasma membrane protein of unknown function, yeast

Gene RIM9, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM9	YMR063W	PPT1	P53043	513 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	HEH2	Q03281	663 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	CAT8	P39113	1433 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	YNL011C	P53980	444 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	DPH6	Q12429	685 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	SEC20	P28791	383 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	MET4	P32389	672 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	PPX1	P38698	397 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	TRK2	P28584	889 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	YBR287W	P38355	427 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	CDC55	Q00362	526 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	RSC4	Q02206	625 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	COB	P00163	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	CTR9	P89105	1077 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	BSC2	Q05611	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	YHL008C	P38750	627 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	ATE1	P16639	503 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	TFA2	P36145	328 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	ALD3	P54114	506 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	RSC2	Q06488	889 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RIM9	YMR063W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	DUR3	P33413	735 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	MDJ1	P35191	511 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	ALG14	P38242	237 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	POL32	P47110	350 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	FUS1	P11710	512 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	HEM3	P28789	327 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	DAK2	P43550	591 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	MON1	P53129	644 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	YNR014W	P53719	212 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	GIS4	Q04233	774 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	TOS4	Q06266	489 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	THI72	Q08579	599 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	FLP1	P03870	423 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	AI1	P03875	834 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	SAM37	P50110	327 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	BOI2	P39969	1040 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	TED1	P40533	473 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	GLO4	Q12320	285 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	VMR1	P38735	1592 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	UGA4	P32837	571 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	LSB6	P42951	607 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	YFL066C	P43538	392 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	YJR124C	P47159	448 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	NSG2	P53898	299 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	MCM2	P29469	868 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	GIP2	P40036	548 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	NEO1	P40527	1151 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	DAL4	Q04895	635 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	TDA6	Q06466	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	SOG2	Q08817	791 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	NHA1	Q99271	985 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM9	YMR063W	NPR1	P22211	790 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	VPS35	P34110	944 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	RIM11	P38615	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	FAA3	P39002	694 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	NUT1	P53114	1132 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	USO1	P25386	1790 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	SRB8	P25648	1427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	MET1	P36150	593 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	MGE1	P38523	228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	PAN5	P38787	379 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	FYV10	P40492	516 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	SPR28	Q04921	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	GAS5	Q08193	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	IML1	P47170	1584 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	BNR1	P40450	1375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	SEC8	P32855	1065 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	RRM3	P38766	723 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	FET4	P40988	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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