RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeastyeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FPR4YLR449W FLO11P08640 1367 aa14.81□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W RXT2P38255 430 aa14.8□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W CRF1Q04930 467 aa14.8□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W YOR111WQ99210 232 aa14.8□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W CDC6P09119 513 aa14.79□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W MPE1P35728 441 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W CSM2P40465 213 aa14.79□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W CEX1Q12453 761 aa14.79□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W HCA4P20448 770 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W MCM3P24279 971 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W PRO3P32263 286 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W GET3Q12154 354 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
FPR4YLR449W GPA1P08539 472 aa14.77□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W AFG2P32794 780 aa14.77□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W YKT6P36015 200 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W PCI8P40512 444 aa14.77□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W SKG3Q06315 1026 aa14.77□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W PRE8P23639 250 aa14.76□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W TOM71P38825 639 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W VPS8P39702 1274 aa14.76□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W CUE3P53137 624 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W AAD16Q02895 342 aa14.76□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W HXK1P04806 485 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W MRPL10P36520 322 aa14.75□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W TRS33Q99394 268 aa14.75□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W SRM1P21827 482 aa14.74□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W YER130CP39959 443 aa14.74□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W UTP7P40055 554 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W YGL138CP53122 345 aa14.74□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W NAF1P53919 492 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data14.74□□□□□ -0.05not detected
FPR4YLR449W ATE1P16639 503 aa14.73□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W VPS1P21576 704 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W MTC3P53077 123 aa14.73□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W KIN1P13185 1064 aa14.72□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W MSM1P22438 575 aa14.72□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W URA1P28272 314 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W ATG20Q07528 640 aa14.72□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W DSE3Q08729 430 aa14.72□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W TUS1Q06412 1307 aa14.71□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W MET6P05694 767 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W RGP1P16664 663 aa14.71□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W MIC60P36112 540 aa14.71□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W RRM3P38766 723 aa14.71□□□□□ -0.05
FPR4YLR449W SRP54P20424 541 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W BMH1P29311 267 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W MCM4P30665 933 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W EBP2P36049 427 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W FOL1P53848 824 aa14.7□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W SGD1Q06132 899 aa14.7□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W TOP1P04786 769 aa14.69□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W NUC1P08466 329 aa14.69□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W CCT3P39077 534 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W FPK1P53739 893 aa14.69□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W TIP41Q12199 356 aa14.69□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W ALG1P16661 449 aa14.68□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W RTC4P53850 401 aa14.68□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W MDM1Q01846 1127 aa14.68□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W PTC5Q12511 572 aa14.68□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W NBL1Q3E7Y6 73 aa14.68□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W GSY2P27472 705 aa14.67□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W CHS3P29465 1165 aa14.67□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W SNU71P53207 620 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W RET3P53600 189 aa14.67□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W VPS30Q02948 557 aa14.67□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W CIT1P00890 479 aa14.66□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W ADP1P25371 1049 aa14.66□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W MCM2P29469 868 aa14.66□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W DAK2P43550 591 aa14.66□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W MMR1Q06324 491 aa14.66□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W CSC1Q06538 782 aa14.66□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W MAK11P20484 414 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W SEC20P28791 383 aa14.65□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W GLC3P32775 704 aa14.65□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W CST26P38226 397 aa14.65□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W SSL2Q00578 843 aa14.65□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W YOR296WQ08748 1289 aa14.65□□□□□ -0.06
FPR4YLR449W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W RAD53P22216 821 aa14.63□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data14.62□□□□□ -0.07not detected
FPR4YLR449W STV1P37296 890 aa14.62□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W YGR117CP53270 476 aa14.62□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W PMA1P05030 918 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W THR4P16120 514 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W YBL028CP38202 106 aa14.61□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W STT3P39007 718 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W TIM50Q02776 476 aa14.61□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W ACE2P21192 770 aa14.6□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W HIR1P32479 840 aa14.6□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W FYV10P40492 516 aa14.6□□□□□ -0.07
FPR4YLR449W LYS14P40971 790 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.8 ms