RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	BSC2	Q05611	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	SAP155	P43612	1002 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	AVT1	P47082	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	NUT1	P53114	1132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	IPL1	P38991	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	FAR11	P53917	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	TOS4	Q06266	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	YIG1	Q08956	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	YAF9	P53930	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	UGA4	P32837	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	LRG1	P35688	1017 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	SLS1	P42900	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	MEC3	Q02574	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	MET4	P32389	672 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	GCV1	P48015	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	YGR045C	P53229	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR224W	YLR224W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	SLD2	P34252	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	THI12	P42883	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	THI5	P43534	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	THI11	P47183	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	THI13	Q07748	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	NEM1	P38757	446 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	RNQ1	P25367	405 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	SEG2	P34250	1132 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	EXO5	P38289	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	MMM1	P41800	426 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	RCM1	P53972	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	SEC20	P28791	383 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	PPX1	P38698	397 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	PMT7	Q06644	662 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	DAK2	P43550	591 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	CIT3	P43635	486 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	ALT1	P52893	592 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLR224W	YLR224W	ATE1	P16639	503 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	PEX7	P39108	375 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	SAM37	P50110	327 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	SSY1	Q03770	852 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	YVC1	Q12324	675 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	NFS1	P25374	497 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	DAL4	Q04895	635 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	MSH3	P25336	1018 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	HSP78	P33416	811 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	YKL077W	P36081	392 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	FAA3	P39002	694 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	PEX13	P80667	386 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	AOS1	Q06624	347 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	DFG16	Q99234	619 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	ULP1	Q02724	621 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	MCM2	P29469	868 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	ELM1	P32801	640 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	TRE1	Q08919	783 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	NSI1	Q12457	570 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	POL32	P47110	350 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	YNR063W	P53749	607 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YLR224W	YLR224W	HEM3	P28789	327 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	PRO1	P32264	428 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.3 ms