RNA–Protein interactions for RNA: YKR027W

BCH2, Transcript of Member of the ChAPs (Chs5p-Arf1p-binding proteins) family, yeast

Gene BCH2, Length 2,298 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCH2	YKR027W	GTT3	P39996	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	ULP1	Q02724	621 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	FLP1	P03870	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	EUG1	P32474	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	RGD2	P43556	714 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	RTP1	Q12751	981 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	MPD2	Q99316	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
BCH2	YKR027W	VMA3	P25515	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	TPD3	P31383	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	PEX6	P33760	1030 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	BLI1	P35727	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	NTA1	P40354	457 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	HUL4	P40985	892 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	PIP2	P52960	996 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	VBA5	P36172	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	RAD55	P38953	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	PEX14	P53112	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	SPC105	P53148	917 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BCH2	YKR027W	NUP145	P49687	1317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	ARE1	P25628	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	PLC1	P32383	869 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MKK2	P32491	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MRP8	P35719	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	SCD5	P34758	872 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	GDH3	P39708	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	CTR9	P89105	1077 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	GAL1	P04385	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MEF1	P25039	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	PSY2	P40164	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	KXD1	P53158	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MET14	Q02196	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	PEX29	Q03370	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MDM12	Q92328	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	FOB1	O13329	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	COB	P00163	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MCM1	P11746	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	DAL5	P15365	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	EXO84	P38261	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	YAP1801	P38856	637 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	ISU1	Q03020	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	JIP4	Q03361	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	PML39	Q03760	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MRL1	Q06815	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	OPI1	P21957	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MSN1	P22148	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	SSH4	P32343	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	PBY1	P38254	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	HSE1	P38753	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	HXT13	P39924	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	HXT17	P53631	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	HXT15	P54854	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	UTR2	P32623	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	HSP78	P33416	811 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	GEM1	P39722	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MGS1	P40151	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	GIC2	Q06648	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	TFC4	P33339	1025 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	BAP2	P38084	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	LDH1	P38139	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	XKS1	P42826	600 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MOD5	P07884	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	NUT1	P53114	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MEH1	Q02205	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	HDA2	Q06629	674 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	TRE2	Q08693	809 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BCH2	YKR027W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 145.6 ms