RNA–Protein interactions for RNA: YKL113C

RAD27, Transcript of 5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease, yeast

Gene RAD27, Length 1,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD27	YKL113C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	TLG1	Q03322	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	LCD1	Q04377	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	SEC2	P17065	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	RPN12	P32496	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	YJL181W	P46987	611 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	TFB4	Q12004	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	PIF1	P07271	859 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	RGR1	P19263	1082 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	SLA1	P32790	1244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	TTI1	P36097	1038 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	PBY1	P38254	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	NPR2	P39923	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	RSC1	P53236	928 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	YNL193W	P53870	558 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	MBR1	P23493	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	YHL017W	P38745	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	RRN7	P40992	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	CTF18	P49956	741 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	ECM23	Q02710	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	ELG1	Q12050	791 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	APC11	Q12157	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD27	YKL113C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	TAF13	P11747	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	RKM3	P38222	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	CWH41	P53008	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	PEX14	P53112	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	TPO2	P53283	614 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	PEX19	Q07418	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	TAH18	Q12181	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	LAM4	P38800	1345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	POM152	P39685	1337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	CYB2	P00175	591 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	CDC4	P07834	779 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	PEP3	P27801	918 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	FBP26	P32604	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RAD27	YKL113C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	MET1	P36150	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	MAL33	P38157	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RAD27	YKL113C	OSW7	P43611	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	YGL081W	P53156	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	ARP5	P53946	755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	KAR5	Q04746	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	RDS1	P25611	832 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	MET22	P32179	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	GEF1	P37020	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	ICP55	P40051	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	VID28	P40547	921 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	IOC3	P43596	787 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	ATG36	P46983	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	YKE2	P52553	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	RTS3	P53289	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	TFB3	Q03290	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	BUG1	Q12191	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	RRI2	Q12348	645 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	MGM1	P32266	881 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	YPR109W	Q06104	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	THI3	Q07471	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	PPM2	Q08282	695 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	DPH6	Q12429	685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	SIT4	P20604	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	CBP3	P21560	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	UBP1	P25037	809 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD27	YKL113C	IMP2'	P32351	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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