RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOP4	YJL192C	GPI13	Q07830	1017 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	TAF2	P23255	1407 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	NPR1	P22211	790 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	RIM11	P38615	370 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	INP52	P50942	1183 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	CDC55	Q00362	526 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	YMR074C	Q04773	145 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	YPK9	Q12697	1472 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	CHS2	P14180	963 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	SCC2	Q04002	1493 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	BPT1	P14772	1559 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	TOS1	P38288	455 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	YOR1	P53049	1477 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	DNA2	P38859	1522 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	FLP1	P03870	423 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	MON1	P53129	644 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	MSH6	Q03834	1242 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	MED7	Q08278	222 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	LIP5	P32875	414 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	YHL050C	P38721	697 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	YHR219W	P38900	624 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	FAR11	P53917	953 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	YIG1	Q08956	461 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	GPT2	P36148	743 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	YOR223W	Q12015	292 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SOP4	YJL192C	RKR1	Q04781	1562 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	SMC4	Q12267	1418 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	CYC7	P00045	113 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	CTH1	P47976	325 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	NUT1	P53114	1132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	SDH1	Q00711	640 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	GIC2	Q06648	383 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	SEA4	P38164	1038 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	YAF9	P53930	226 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	PDR10	P51533	1564 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	ATG2	P53855	1592 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	SSM4	P40318	1319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	CAB3	P36076	571 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	SAP155	P43612	1002 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	SPO74	P45819	413 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	GCV1	P48015	400 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	SWR1	Q05471	1514 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	UGA4	P32837	571 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	PMT7	Q06644	662 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	BRE4	Q07660	1125 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
SOP4	YJL192C	WHI5	Q12416	295 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	SAM37	P50110	327 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	MEC3	Q02574	474 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	TOS4	Q06266	489 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	BUD4	P47136	1447 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	IRC20	Q06554	1556 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SOP4	YJL192C	ULS1	Q08562	1619 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	MET4	P32389	672 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	MMM1	P41800	426 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	EAR1	Q03212	550 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	YLL054C	Q12244	843 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	RPO31	P04051	1460 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	KOG1	P38873	1557 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	EXO5	P38289	585 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	THI12	P42883	340 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	THI5	P43534	340 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	THI11	P47183	340 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61

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