RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	ROX1	P25042	368 aa		7.2	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	PBY1	P38254	753 aa		7.2	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	RAD59	Q12223	238 aa		7.2	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	FIG2	P25653	1609 aa		7.2	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	POM152	P39685	1337 aa		7.2	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	IXR1	P33417	597 aa		7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	YGL081W	P53156	320 aa		7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	THI3	Q07471	609 aa		7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	RRI2	Q12348	645 aa		7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	CLC1	P17891	233 aa		7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	MSP1	P28737	362 aa		7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	ASH1	P34233	588 aa		7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	TOS1	P38288	455 aa		7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	HPC2	Q01448	625 aa		7.19	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	MGM1	P32266	881 aa		7.18	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	BDF2	Q07442	638 aa		7.18	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	MET32	Q12041	191 aa		7.18	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	LAM4	P38800	1345 aa		7.17	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	YBL086C	P38177	466 aa		7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	YIR042C	P40586	236 aa		7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	RGA2	Q06407	1009 aa		7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	DPH6	Q12429	685 aa		7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	VAC17	P25591	423 aa		7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	ICP55	P40051	511 aa		7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	ALD2	P47771	506 aa		7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	ALD3	P54114	506 aa		7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	SPL2	P38839	148 aa		7.15	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	VID28	P40547	921 aa		7.14	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	ENT3	P47160	408 aa		7.14	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	INM2	Q05533	292 aa		7.14	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	HRQ1	Q05549	1077 aa		7.14	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	PIF1	P07271	859 aa		7.13	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	OPI1	P21957	404 aa		7.13	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	GRX7	P38068	203 aa		7.13	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	BRL1	P38770	471 aa		7.13	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	CTF18	P49956	741 aa		7.13	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	KAR5	Q04746	504 aa		7.13	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	IRC3	Q06683	689 aa		7.13	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	BIK1	P11709	440 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	IMP2'	P32351	346 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	BDH2	P39713	417 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	SPO22	P40511	975 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	IRC4	Q03036	179 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	GSC2	P40989	1895 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	ARP5	P53946	755 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	PEP3	P27801	918 aa		7.11	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	CIR1	P42940	261 aa		7.11	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	IRC8	P47046	822 aa		7.11	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	PPM2	Q08282	695 aa		7.11	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	TAH18	Q12181	623 aa		7.11	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	KRE2	P27809	442 aa		7.1	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	PFF1	P38244	976 aa		7.1	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	HST1	P53685	503 aa		7.1	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	TOS4	Q06266	489 aa		7.1	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	FLO1	P32768	1537 aa		7.1	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	MET1	P36150	593 aa		7.09	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	LEO1	P38439	464 aa		7.09	□□□□□ -1.27
YCK1	YHR135C	TEC1	P18412	486 aa		7.09	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	COQ1	P18900	473 aa		7.09	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	MBR1	P23493	339 aa		7.09	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	FBP26	P32604	452 aa		7.09	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.09	□□□□□ -1.28	not detected
YCK1	YHR135C	UGA2	P38067	497 aa		7.09	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	ECM23	Q02710	187 aa		7.09	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	PEX19	Q07418	342 aa		7.09	□□□□□ -1.28
YCK1	YHR135C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28

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