RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	LSO1	Q3E827	93 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CPR4	YCR069W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	YOR093C	Q12275	1648 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	RPB10	P22139	70 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	RSC2	Q06488	889 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	TAT1	P38085	619 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	PPT1	P53043	513 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	MCA1	Q08601	432 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	SCT1	P32784	759 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	YBR287W	P38355	427 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	RGD2	P43556	714 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	YJL181W	P46987	611 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	BUD9	P53226	547 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	YAP3	P38749	330 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	RRM3	P38766	723 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	AIM46	P38885	310 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	SLP1	Q12232	587 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	IML1	P47170	1584 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	NTA1	P40354	457 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	GAS5	Q08193	484 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CPR4	YCR069W	SMC1	P32908	1225 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	RAD55	P38953	406 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	LSB6	P42951	607 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	KAR5	Q04746	504 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	RAV1	P47104	1357 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	GIP2	P40036	548 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	TED1	P40533	473 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	VMR1	P38735	1592 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	AI3	P03877	415 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	IPL1	P38991	367 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	PSY2	P40164	858 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	YPL034W	Q03083	165 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	RTC1	Q08281	1341 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	DNF3	Q12674	1656 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	FUS1	P11710	512 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	QDR1	P40475	563 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	ALD3	P54114	506 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	SAC7	P17121	654 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	SFA1	P32771	386 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	TFA2	P36145	328 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CPR4	YCR069W	ATG1	P53104	897 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	SOG2	Q08817	791 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	GUP1	P53154	560 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	ESL2	P36168	1195 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	GEF1	P37020	779 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	PAN5	P38787	379 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	LEM3	P42838	414 aa		6.18	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	DSE4	P53753	1117 aa		6.18	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	UFD2	P54860	961 aa		6.18	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	RSC6	P25632	483 aa		6.16	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	ACF4	P47129	309 aa		6.16	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	YJR124C	P47159	448 aa		6.16	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	PDR11	P40550	1411 aa		6.16	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	NEO1	P40527	1151 aa		6.15	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.15	□□□□□ -1.42	RIP-Chip
CPR4	YCR069W	MAK10	Q02197	733 aa		6.15	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	GLO4	Q12320	285 aa		6.15	□□□□□ -1.42
CPR4	YCR069W	HVG1	P0CE11	249 aa		6.14	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	YNR065C	P53751	1116 aa		6.14	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	CTR9	P89105	1077 aa		6.14	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	RSC4	Q02206	625 aa		6.14	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	SPO71	Q03868	1245 aa		6.14	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	TRS120	Q04183	1289 aa		6.14	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	BCK1	Q01389	1478 aa		6.14	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	COQ2	P32378	372 aa		6.13	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	ERP5	P38819	212 aa		6.12	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	HAT1	Q12341	374 aa		6.12	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		6.12	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	NUP192	P47054	1683 aa		6.11	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	COB	P00163	385 aa		6.11	□□□□□ -1.43
CPR4	YCR069W	FET4	P40988	552 aa		6.11	□□□□□ -1.43

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