RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 IDI1Q13907 227 aa8.49□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 LMBRD1Q9NUN5 540 aa8.49□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLKQ9UBT6 870 aa8.49□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABCC11Q96J66 1382 aa8.49□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.49□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa8.49□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.49□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.49□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 DTNBO60941 627 aa8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 GLI2P10070 1586 aa8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAPGEF3O95398 923 aa8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP26Q9BXU7 913 aa8.48□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 IL16Q14005 1332 aa8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 GCC1Q96CN9 775 aa8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPLO60437 1756 aa8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDK19Q9BWU1 502 aa8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNF214Q8ND24 703 aa8.47□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.46□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDC45O75419 566 aa8.46□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 SDSP20132 328 aa8.46□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.46□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.46□□□□□ -1.05
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP32Q8NFA0 1604 aa8.46□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 MED14O60244 1454 aa8.46□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 FCHSD2O94868 740 aa8.46□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.46□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.46□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.46□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 SYCE3A1L190 88 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABCC4O15439 1325 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 TTC22Q5TAA0 569 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 NSD2O96028 1365 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 OFD1O75665 1012 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.45□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 NFE2L2Q16236 605 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 NME9Q86XW9 330 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF853P0CG23 659 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 TSC1Q92574 1164 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 DCTPP1Q9H773 170 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 MEIS3Q99687 375 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.44□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF445P59923 1031 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 IL13P35225 146 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 MCM10Q7L590 875 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 PIK3R4Q99570 1358 aa8.43□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 PTCH1Q13635 1447 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 PALD1Q9ULE6 856 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 F6X3S4 739 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 RABEP1Q15276 862 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 ASXL2Q76L83 1435 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM177BA6PVY3 158 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 TPM2P07951 284 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 CEP85Q6P2H3 762 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms