RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 IRF6O14896 467 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF853P0CG23 659 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 DONSONQ9NYP3 566 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 KIF16BQ96L93 1317 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 CAPN2P17655 700 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 TDO2P48775 406 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 ICE2Q659A1 982 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 MIA2Q96PC5 1412 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF217Q8TC41 542 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 MRS2Q9HD23 443 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 PHLPP1O60346 1717 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 GUCY2CP25092 1073 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 SIRT1Q96EB6 747 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBTB9Q96C00 473 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 KIF3CO14782 793 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 MED4Q9NPJ6 270 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 RAD50Q92878 1312 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 SLFN14P0C7P3 912 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.123e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-208ENST00000471759 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 JCADQ9P266 1359 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 LIG1P18858 919 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 TRDNQ13061 729 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 TERF2Q15554 542 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 C8orf34Q49A92 452 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM210AQ96ND0 272 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 MAP3K1Q13233 1512 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 KIF3BO15066 747 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 ITFG2Q969R8 447 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 GBP4Q96PP9 640 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 NBPF3Q9H094 633 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 DEF6Q9H4E7 631 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 LRP6O75581 1613 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 ERVK-7P63135 1459 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 SLIT1O75093 1534 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 NRDCO43847 1150 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 RPAINQ86UA6 219 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 MPNDQ8N594 471 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 SGSM3Q96HU1 749 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms