RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ERBB4Q15303 1308 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 LTKP29376 864 aa22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 DLC1Q96QB1 1528 aa22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 CABP1Q9NZU7 370 aa22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 C3P01024 1663 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 FBLN1P23142 703 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 GBP4Q96PP9 640 aa22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 MED14O60244 1454 aa22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKAR2BP31323 418 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 FCHSD2O94868 740 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.83■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.83■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF2CQ99661 725 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 PTMSP20962 102 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPYL6Q8N831 410 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 HMOX1P09601 288 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 TECPR2O15040 1411 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 VAMP4O75379 141 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 POLKQ9UBT6 870 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 GCC1Q96CN9 775 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF428Q96B54 188 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 CPS1P31327 1500 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMYND15Q9H091 742 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 TPM2P07951 284 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 NFE2L2Q16236 605 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 EID1Q9Y6B2 187 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 SIRT1Q96EB6 747 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 PTCH1Q13635 1447 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRUQ92729 1446 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3R4Q99570 1358 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP7BP35670 1465 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 MBIPQ9NS73 344 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 SLIT1O75093 1534 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 SSFA2P28290 1259 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCC4O15439 1325 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 NUTM2FA1L443 756 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-208ENST00000424082 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-208ENST00000424082 GNAI1P63096 354 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms