RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRD1	YOL013C	GIP2	P40036	548 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	PRY1	P47032	299 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	BUD9	P53226	547 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	GUP1	P53154	560 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	HAT1	Q12341	374 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	FUS1	P11710	512 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	LEM3	P42838	414 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	TED1	P40533	473 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	SOG2	Q08817	791 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	AI3	P03877	415 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	HEM3	P28789	327 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	SFA1	P32771	386 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	ERP5	P38819	212 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	ALD3	P54114	506 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	RSC4	Q02206	625 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	SAC7	P17121	654 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	LSB6	P42951	607 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	DSE4	P53753	1117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	MCA1	Q08601	432 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	YTA7	P40340	1379 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	YNL011C	P53980	444 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	TFA2	P36145	328 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	IPL1	P38991	367 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	MDJ2	P42834	146 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HRD1	YOL013C	RSC6	P25632	483 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	PAN5	P38787	379 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	YJR124C	P47159	448 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	GAS5	Q08193	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	BRN1	P38170	754 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	OCA5	P38738	679 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	CDC55	Q00362	526 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	GLO4	Q12320	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	SPC42	P36094	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	NEO1	P40527	1151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	CTR9	P89105	1077 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	BSC2	Q05611	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	MNL2	Q12205	849 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	FET4	P40988	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	NUT2	Q06213	157 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	YHL008C	P38750	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	ATG36	P46983	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	FAR11	P53917	953 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	ELG1	Q12050	791 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	FRT1	Q99332	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	COB	P00163	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	FLP1	P03870	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	TOP1	P04786	769 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	COQ2	P32378	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	SAM37	P50110	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HRD1	YOL013C	NPR1	P22211	790 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	YHL050C	P38721	697 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	YHR219W	P38900	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	ATE1	P16639	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	RIM11	P38615	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	SAF1	P38352	637 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	PMT7	Q06644	662 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	REC8	Q12188	680 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	ERS1	P17261	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	DUR3	P33413	735 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	KAE1	P36132	386 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	NUT1	P53114	1132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	NCE103	P53615	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	SAP155	P43612	1002 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	DOS2	P54858	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HRD1	YOL013C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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