RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	MRX10	Q05648	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	GAS5	Q08193	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	ALG14	P38242	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	YTA6	P40328	754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	YJL007C	P47080	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	DNM1	P54861	757 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	CDC11	P32458	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	INP52	P50942	1183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	OMA1	P36163	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	MTO1	P53070	669 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	YNR040W	P53736	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	HAT1	Q12341	374 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	RPN12	P32496	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	GRX7	P38068	203 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	BIM1	P40013	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	PKH1	Q03407	766 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	NKP1	Q12493	238 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	SPT7	P35177	1332 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	MRP10	O75012	95 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	QCR6	P00127	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	HEH2	Q03281	663 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	GIS4	Q04233	774 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	NSE3	Q05541	303 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	CYT1	P07143	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	CPS1	P27614	576 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	TFC3	P34111	1160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	MAL31	P38156	614 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	MUM2	P38236	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	TSC13	Q99190	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	SWI3	P32591	825 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	PEP12	P32854	288 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	NFU1	P32860	256 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	IPL1	P38991	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	PEA2	P40091	420 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	ATG32	P40458	529 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	SKP1	P52286	194 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	ALG12	P53730	551 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	SVF1	Q05515	481 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	AI3	P03877	415 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
YPT53	YNL093W	DPB3	P27344	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	SEC6	P32844	805 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YPT53	YNL093W	PPH3	P32345	308 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	GRX4	P32642	244 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	RRM3	P38766	723 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	TAF1	P46677	1066 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	HSP42	Q12329	375 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	TRP3	P00937	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
YPT53	YNL093W	KAP122	P32767	1081 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	FUI1	P38196	639 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	HXT5	P38695	592 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	KTR7	P40504	517 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	DJP1	P40564	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	RCF1	Q03713	159 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	CIT2	P08679	460 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YPT53	YNL093W	SAC7	P17121	654 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.2 ms