RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	YOR131C	Q12486	218 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	SRS2	P12954	1174 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	ADP1	P25371	1049 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	OCT1	P35999	772 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	ACA1	P39970	489 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	HXT10	P43581	546 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	YPL034W	Q03083	165 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	ECM30	Q06673	1274 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	AHC1	Q12433	566 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	UIP5	P36137	443 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	YGR122W	P53272	402 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	SRT1	Q03175	343 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	HIP1	P06775	603 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	SWC3	P31376	625 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	APL6	P46682	809 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	MAM3	Q12296	706 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	YBL028C	P38202	106 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	LYS14	P40971	790 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	YFL040W	P43562	540 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	ICL2	Q12031	575 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	SUT2	Q12286	268 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	GYP5	Q12344	894 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	VAB2	P40003	282 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	YIR042C	P40586	236 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	MDL2	P33311	773 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	UBP12	P39538	1254 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	AFG3	P39925	761 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	YJL007C	P47080	104 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	YJR107W	P47145	328 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	DAN4	P47179	1161 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	NSG2	P53898	299 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	HTA2	P04912	132 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	SNF3	P10870	884 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	TPD3	P31383	635 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	INM2	Q05533	292 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.49	□□□□□ -1.53	not detected
YNL057W	YNL057W	RAD24	P32641	659 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	SLA1	P32790	1244 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	KTR2	P33550	425 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	DCW1	P36091	449 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	SAP30	P38429	201 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	FMP30	Q02883	468 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	MET7	Q08645	548 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	MIP1	P15801	1254 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	MSC7	P38694	644 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	YHR131C	P38835	850 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	AIM21	P40563	679 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	TOR1	P35169	2470 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	KIN1	P13185	1064 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	EUG1	P32474	517 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	YEL023C	P39992	682 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	MXR1	P40029	184 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	YDL129W	Q07555	291 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	PCL8	Q08966	492 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	RRI2	Q12348	645 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YNL057W	YNL057W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	DIT2	P21595	489 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	PKC1	P24583	1151 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	BCS1	P32839	456 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	PTC4	P38089	393 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	UBX5	Q06682	500 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	TUS1	Q06412	1307 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	PIP2	P52960	996 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	DUS4	Q06063	367 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	LAP2	Q10740	671 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	PER1	P25625	357 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	CST26	P38226	397 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.9 ms