RNA–Protein interactions for RNA: YLR363C

NMD4, Transcript of Protein that may be involved in nonsense-mediated mRNA decay, yeast

Gene NMD4, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD4	YLR363C	NHA1	Q99271	985 aa		8.02	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	FRT1	Q99332	602 aa		8.02	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	CDC55	Q00362	526 aa		8.01	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	TDA6	Q06466	467 aa		8	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	FUS1	P11710	512 aa		7.99	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	SLP1	Q12232	587 aa		7.99	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	SLD2	P34252	453 aa		7.98	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	ALD3	P54114	506 aa		7.97	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	YML020W	Q03722	664 aa		7.97	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	BSC2	Q05611	235 aa		7.97	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	RGA2	Q06407	1009 aa		7.97	□□□□□ -1.13
NMD4	YLR363C	SEC20	P28791	383 aa		7.96	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	PPX1	P38698	397 aa		7.96	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	GPI13	Q07830	1017 aa		7.96	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	SOG2	Q08817	791 aa		7.96	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	GUP1	P53154	560 aa		7.95	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	7.95	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	CTR9	P89105	1077 aa		7.95	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	YMR187C	Q03236	431 aa		7.95	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		7.95	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	TFA2	P36145	328 aa		7.94	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	GIP2	P40036	548 aa		7.94	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	LEM3	P42838	414 aa		7.94	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	SAM37	P50110	327 aa		7.93	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	YHL008C	P38750	627 aa		7.92	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	GLO4	Q12320	285 aa		7.92	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	PEP1	P32319	1579 aa		7.92	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	TED1	P40533	473 aa		7.91	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		7.9	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	COB	P00163	385 aa		7.9	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	FLP1	P03870	423 aa		7.9	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	IPL1	P38991	367 aa		7.9	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	YJR124C	P47159	448 aa		7.9	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	MTC5	Q03897	1148 aa		7.9	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		7.9	□□□□□ -1.14
NMD4	YLR363C	SSN2	P38931	1420 aa		7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	HVG1	P0CE11	249 aa		7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	RRM3	P38766	723 aa		7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	SKN7	P38889	622 aa		7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	THI12	P42883	340 aa		7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	THI5	P43534	340 aa		7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	THI11	P47183	340 aa		7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	YNR065C	P53751	1116 aa		7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	MSH6	Q03834	1242 aa		7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	THI13	Q07748	340 aa		7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	BUD9	P53226	547 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	YDR215C	Q12240	137 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	MET4	P32389	672 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	PAN5	P38787	379 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	NEO1	P40527	1151 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	FET4	P40988	552 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	LSB6	P42951	607 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	WHI5	Q12416	295 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	ATG2	P53855	1592 aa		7.86	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	SAC7	P17121	654 aa		7.86	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	RIM11	P38615	370 aa		7.86	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	DSE4	P53753	1117 aa		7.86	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	SPO71	Q03868	1245 aa		7.86	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	REV3	P14284	1504 aa		7.86	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	DUR3	P33413	735 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	VPS35	P34110	944 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	PRY1	P47032	299 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	NPR1	P22211	790 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	SFA1	P32771	386 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	TAT1	P38085	619 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	SAP155	P43612	1002 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	NUT1	P53114	1132 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	PMT7	Q06644	662 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NMD4	YLR363C	AI3	P03877	415 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	YCS4	Q06156	1176 aa		7.83	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	GAS5	Q08193	484 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	HEM3	P28789	327 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	DAK2	P43550	591 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NMD4	YLR363C	OXR1	Q08952	273 aa		7.8	□□□□□ -1.16

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