RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	GTT3	P39996	337 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	RTF1	P53064	558 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	KRE28	Q04431	385 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	IOC2	Q12072	812 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	TPD3	P31383	635 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SEC66	P33754	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ERC1	P38767	581 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	HST2	P53686	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	GCR2	Q01722	534 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CAB1	Q04430	367 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CIR2	Q08822	631 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SLX4	Q12098	748 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ATG9	Q12142	997 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	PDR18	P53756	1333 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SWC3	P31376	625 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	TTI1	P36097	1038 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	TAF5	P38129	798 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ILM1	P47155	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CTH1	P47976	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	BTN2	P53286	410 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ASI1	P54074	624 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SRC1	Q03707	834 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ATE1	P16639	503 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ELM1	P32801	640 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	RTG3	P38165	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	BRN1	P38170	754 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	RBA50	Q04418	439 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SAC3	P46674	1301 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	STE11	P23561	717 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CLB4	P24871	460 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	MET4	P32389	672 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YEL1	P34225	687 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SHC1	P39000	512 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	TAF1	P46677	1066 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	DSL1	P53847	754 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	LYS2	P07702	1392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	BUD14	P27637	709 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	TFC3	P34111	1160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	LHS1	P36016	881 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YML119W	Q03208	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	NKP2	Q06162	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	OSW7	P43611	510 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	BET4	Q00618	327 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	STE23	Q06010	1027 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	MMR1	Q06324	491 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SDH5	Q08230	162 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YOR238W	Q08634	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	TRS33	Q99394	268 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SWI1	P09547	1314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	PDR1	P12383	1068 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	PMR1	P13586	950 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	FAR1	P21268	830 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CPS1	P27614	576 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	PTH2	P34222	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ECM4	P36156	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	HXT13	P39924	564 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YIR042C	P40586	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SNF2	P22082	1703 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	GAL11	P19659	1081 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
SKG6	YHR149C	YKR018C	P36114	725 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	ORM1	P53224	222 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SEC5	P89102	971 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	RSF2	P46974	1380 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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