RNA–Protein interactions for RNA: YGL207W

SPT16, Transcript of Subunit of the heterodimeric FACT complex (Spt16p-Pob3p), yeast

Gene SPT16, Length 3,108 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT16	YGL207W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SEC2	P17065	759 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	APN1	P22936	367 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	MEF1	P25039	761 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	DAL1	P32375	460 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	ARP9	Q05123	467 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	TMA17	Q12513	150 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	REC107	P21651	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
SPT16	YGL207W	ALF1	P53904	254 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	RMD1	Q03441	430 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	JIP3	O13555	125 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	MSH2	P25847	964 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	NIP100	P33420	868 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	ORC6	P38826	435 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	RET2	P43621	546 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YML131W	Q03102	365 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	PLP2	Q12017	286 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	MED1	Q12321	566 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	MIP1	P15801	1254 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SPO16	P17122	198 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	TFB1	P32776	642 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	HSM3	P38348	480 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SGM1	P47166	707 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	PIP2	P52960	996 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SPC105	P53148	917 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SSL2	Q00578	843 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	TAF11	Q04226	346 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	LCD1	Q04377	747 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	REH1	Q06709	432 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	MSB4	Q12317	492 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	HAP4	P14064	554 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	NPR1	P22211	790 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	NUP120	P35729	1037 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YAP1802	P53309	568 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	HST2	P53686	357 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	MST1	P07236	462 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	BUD2	P33314	1104 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	MIC60	P36112	540 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YBR071W	P38243	211 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YFR006W	P43590	535 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	APL6	P46682	809 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	VTC3	Q02725	835 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SSP2	Q08646	371 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	RAD59	Q12223	238 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	GAL1	P04385	528 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	MRPL25	P23369	157 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YKL069W	P36088	180 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	KAR5	Q04746	504 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	TFC6	Q06339	672 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	ATG13	Q06628	738 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	CBP3	P21560	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	PPH3	P32345	308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SAS3	P34218	831 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SWD1	P39706	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	PEX21	P50091	288 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	YOR238W	Q08634	303 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	HSF1	P10961	833 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	CYC8	P14922	966 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	NAS2	P40555	220 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	PFD1	P46988	109 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	NNF2	P53253	936 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	NIS1	P53939	407 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	ESC2	Q06340	456 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT16	YGL207W	PET111	P08468	800 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT16	YGL207W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT16	YGL207W	PLC1	P32383	869 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT16	YGL207W	SUV3	P32580	737 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT16	YGL207W	IME2	P32581	645 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT16	YGL207W	YAP1801	P38856	637 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT16	YGL207W	VPS8	P39702	1274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT16	YGL207W	NPY1	P53164	384 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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