RNA–Protein interactions for RNA: YGL039W

YGL039W, Transcript of Oxidoreductase shown to reduce carbonyl compounds to chiral alcohols, yeast

Gene YGL039W, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL039W	YGL039W	SAF1	P38352	637 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	ACF4	P47129	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	CHS2	P14180	963 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	MSN1	P22148	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	BSD2	P38356	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	HXT8	P40886	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	CTH1	P47976	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	YGR130C	P53278	816 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	TED1	P40533	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	ELM1	P32801	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	GIP1	P38229	639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	GIP2	P40036	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	RGD2	P43556	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	ITC1	P53125	1264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	ISW1	P38144	1129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	AKR1	P39010	764 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	NTA1	P40354	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	NUT2	Q06213	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	FRT1	Q99332	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	SMC1	P32908	1225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	DSE4	P53753	1117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	MNL2	Q12205	849 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGL039W	YGL039W	CYC7	P00045	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	RAD55	P38953	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	UFD2	P54860	961 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
YGL039W	YGL039W	YHL050C	P38721	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	YHR219W	P38900	624 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	FIR1	P40020	876 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	YIL165C	P40446	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	SPO74	P45819	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	RSC4	Q02206	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	RSC2	Q06488	889 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	REC8	Q12188	680 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	YBR287W	P38355	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	PPX1	P38698	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	PSY2	P40164	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	AIM46	P38885	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	YJL181W	P46987	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	SEC20	P28791	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	IPL1	P38991	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	UBP5	P39944	805 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	WHI5	Q12416	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	PPT1	P53043	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	YNL011C	P53980	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	CDC55	Q00362	526 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YGL039W	YGL039W	HEM3	P28789	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	MET4	P32389	672 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	CTR9	P89105	1077 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	RNQ1	P25367	405 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	PAN5	P38787	379 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	COB	P00163	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	ALD3	P54114	506 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	TFA2	P36145	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	THI12	P42883	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	THI5	P43534	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	THI11	P47183	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	BSC2	Q05611	235 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	THI13	Q07748	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	FUS1	P11710	512 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	ASF1	P32447	279 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	DUR3	P33413	735 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	LEM3	P42838	414 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	GUP1	P53154	560 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	SDH1	Q00711	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	FLP1	P03870	423 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	SEG2	P34250	1132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	SEA4	P38164	1038 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	SAM37	P50110	327 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	NCE103	P53615	221 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGL039W	YGL039W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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