RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	BAS1	P22035	811 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	SQT1	P35184	431 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	NUP82	P40368	713 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	JJJ2	P46997	583 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YJR115W	P47152	169 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YPL109C	Q02981	657 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	ADI1	Q03677	179 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	HED1	Q03937	162 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	MRL1	Q06815	381 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	RAD27	P26793	382 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	TOM20	P35180	183 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	SSN3	P39073	555 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	RSM26	P47141	266 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	TYW3	P53177	273 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	RTS3	P53289	263 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	RTT10	Q08924	1013 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	CCP1	P00431	361 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	ARG82	P07250	355 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	IRE1	P32361	1115 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
YMR31	YFR049W	TIM23	P32897	222 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YKL069W	P36088	180 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	TAT2	P38967	592 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	PIC2	P40035	300 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	XKS1	P42826	600 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	NUT1	P53114	1132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YGR053C	P53234	283 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YOR296W	Q08748	1289 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	PHO8	P11491	566 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	THI4	P32318	326 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	DLD1	P32891	587 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	DUT1	P33317	147 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	MSN5	P52918	1224 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YGR125W	P53273	1036 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	PEX13	P80667	386 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	CTR9	P89105	1077 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	UBX5	Q06682	500 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	SPO75	Q07798	868 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	FLC1	Q08967	793 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	MET32	Q12041	191 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	OSH2	Q12451	1283 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	SRF1	Q12516	437 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	COB	P00163	385 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	TOP1	P04786	769 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	RPC31	P17890	251 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	DUR3	P33413	735 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YBR184W	P38299	523 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	AAD14	P42884	376 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YJR142W	P47173	342 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	CLA4	P48562	842 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	HST3	P53687	447 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	PMT7	Q06644	662 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	YLR125W	Q12138	136 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YMR31	YFR049W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	PEX28	P38848	579 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	YIL165C	P40446	119 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ATG36	P46983	293 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	PSH1	Q12161	406 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ERR1	P0CX10	437 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ERR2	P0CX11	437 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	GAL11	P19659	1081 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ARE1	P25628	610 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ASH1	P34233	588 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	ITC1	P53125	1264 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	EEB1	Q02891	456 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.51	□□□□□ -1.85	not detected
YMR31	YFR049W	MSH6	Q03834	1242 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SPO20	Q04359	397 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	PPM2	Q08282	695 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SRM1	P21827	482 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	AMS1	P22855	1083 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	DAL1	P32375	460 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	GRX4	P32642	244 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	SLA1	P32790	1244 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	STE5	P32917	917 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YMR31	YFR049W	APM2	P38700	605 aa		3.5	□□□□□ -1.85

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