RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C ERV41Q04651 352 aa3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RPN7Q06103 429 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C LCB5Q06147 687 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C TSC11P40061 1430 aa3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C MSH3P25336 1018 aa3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C PDC6P26263 563 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C BOI1P38041 980 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C DYS1P38791 387 aa3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C FIR1P40020 876 aa3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C QDR2P40474 542 aa3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C ALD3P54114 506 aa3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C TY1A-DR3Q12441 440 aa3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C CDC19P00549 500 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C TRL1P09880 827 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C YBR287WP38355 427 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RPS31P05759 152 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C SEC20P28791 383 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C YHL050CP38721 697 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C YHR219WP38900 624 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C MDJ2P42834 146 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C THI12P42883 340 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C THI5P43534 340 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C THI11P47183 340 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C GRX3Q03835 250 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C THI13Q07748 340 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C TY1A-BLQ12266 440 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C NOP14Q99207 810 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C HSL1P34244 1518 aa3.7□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RAD51P25454 400 aa3.69□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C HOS4P40480 1083 aa3.69□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C VPS30Q02948 557 aa3.69□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RAD9P14737 1309 aa3.69□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C HXT8P40886 569 aa3.69□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C YNL050CP53952 270 aa3.69□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C LEU1P07264 779 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C KAR3P17119 729 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RPB10P22139 70 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C SMC1P32908 1225 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C BRN1P38170 754 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RAD26P40352 1085 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C HUL5P53119 910 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C ASF1P32447 279 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C MRPL16P38064 232 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C TCD1P38756 429 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C DSN1P40568 576 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C UFD2P54860 961 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C MSC6Q08818 692 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C YLL054CQ12244 843 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C STB3Q12427 513 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C HEM3P28789 327 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C MED8P38304 223 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C CIN4P39110 191 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C PXR1P53335 271 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C YOR389WQ08912 624 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C APC11Q12157 165 aa3.68□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RGP1P16664 663 aa3.67□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RNT1Q02555 471 aa3.67□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C NUT2Q06213 157 aa3.67□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C TRM3Q07527 1436 aa3.67□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C TY1B-DR4Q07793 1604 aa3.67□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C ISW1P38144 1129 aa3.67□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C IPL1P38991 367 aa3.67□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C CAF120P53836 1060 aa3.67□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C TRS120Q04183 1289 aa3.67□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RPC82P32349 654 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RRP14P36080 434 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C NPR3P38742 1146 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C ROG3P43602 733 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RSC8P43609 557 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C ALD2P47771 506 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C NAM8Q00539 523 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C GGA1Q06336 557 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data3.66□□□□□ -1.82not detected
DOA4YDR069C DNA2P38859 1522 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RAD3P06839 778 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C CLN1P20437 546 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C MSN1P22148 382 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C GIP1P38229 639 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C RAD55P38953 406 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C ECM1P39715 212 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C DOS2P54858 310 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C VPS60Q03390 229 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C TY1A-MR1Q04215 440 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C YOL087CQ99247 1116 aa3.66□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C EFB1P32471 206 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C NCL1P38205 684 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
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