RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W PUN1Q06991 263 aa6.18□□□□□ -1.42
NSE4YDL105W MSN1P22148 382 aa6.17□□□□□ -1.42
NSE4YDL105W PAN5P38787 379 aa6.17□□□□□ -1.42
NSE4YDL105W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
NSE4YDL105W ISC10P32645 267 aa6.16□□□□□ -1.42
NSE4YDL105W SRS2P12954 1174 aa6.15□□□□□ -1.42
NSE4YDL105W FIR1P40020 876 aa6.15□□□□□ -1.42
NSE4YDL105W BIO5P53744 561 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
NSE4YDL105W SOG2Q08817 791 aa6.15□□□□□ -1.42
NSE4YDL105W MAE1P36013 669 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W TAF7Q05021 590 aa6.14□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W POL5P39985 1022 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W NCE103P53615 221 aa6.12□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W SPO71Q03868 1245 aa6.12□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W FUS1P11710 512 aa6.11□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W AIM46P38885 310 aa6.11□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W HXT8P40886 569 aa6.1□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W ALD3P54114 506 aa6.1□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W YML083CQ04526 418 aa6.1□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W RRN6P32786 894 aa6.09□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W TFA2P36145 328 aa6.09□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W UBP5P39944 805 aa6.09□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W ELG1Q12050 791 aa6.09□□□□□ -1.43
NSE4YDL105W PNP1Q05788 311 aa6.07□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W GIC2Q06648 383 aa6.07□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W NEO1P40527 1151 aa6.05□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W BOI1P38041 980 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W NTA1P40354 457 aa6.04□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W RGD2P43556 714 aa6.04□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W ECL1P48235 211 aa6.04□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W FAR11P53917 953 aa6.04□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W APC11Q12157 165 aa6.04□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W RNQ1P25367 405 aa6.03□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W NIT1P40447 199 aa6.03□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W YJR124CP47159 448 aa6.03□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W KIP3P53086 805 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W SDH1Q00711 640 aa6.03□□□□□ -1.44
NSE4YDL105W ERS1P17261 260 aa6.02□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W SUT1P53032 299 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W YNR065CP53751 1116 aa6.02□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W NSI1Q12457 570 aa6.02□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W LSO1Q3E827 93 aa6.02□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W FUR4P05316 633 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W SEG2P34250 1132 aa6.01□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W RLF2Q12495 606 aa6.01□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W HVG1P0CE11 249 aa6□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W SMC1P32908 1225 aa6□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W LRG1P35688 1017 aa6□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W SEA4P38164 1038 aa6□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W POL12P38121 705 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W RAD55P38953 406 aa5.99□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W MMM1P41800 426 aa5.99□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W YOR223WQ12015 292 aa5.99□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W KTR2P33550 425 aa5.98□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W IRS4P36115 615 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W FET4P40988 552 aa5.98□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W CIT3P43635 486 aa5.98□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W GLO4Q12320 285 aa5.98□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W DFG16Q99234 619 aa5.98□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W PSY2P40164 858 aa5.97□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W PRP43P53131 767 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W YLL054CQ12244 843 aa5.97□□□□□ -1.45
NSE4YDL105W RPB10P22139 70 aa5.96□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W YMR074CQ04773 145 aa5.96□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W BOL3P39724 118 aa5.94□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W YCR015CP25616 317 aa5.93□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W GPT2P36148 743 aa5.92□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W RCM1P53972 490 aa5.92□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W GAS1P22146 559 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W YKL222CP35995 705 aa5.91□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W GCV1P48015 400 aa5.91□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W YHL008CP38750 627 aa5.9□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
NSE4YDL105W HSP78P33416 811 aa5.89□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W UFD2P54860 961 aa5.89□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W KAR5Q04746 504 aa5.89□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W YIG1Q08956 461 aa5.88□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W GLO3P38682 493 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W ESC8Q08119 714 aa5.87□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W QDR1P40475 563 aa5.86□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W ADP1P25371 1049 aa5.85□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W TSA1P34760 196 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W ORC3P54790 616 aa5.85□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W RSC4Q02206 625 aa5.85□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W CDA2Q06703 312 aa5.85□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W ECM2P38241 364 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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