RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 IFT172Q9UG01 1749 aa25.76■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 SLC24A1O60721 1099 aa25.75■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 SNX21Q969T3 373 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.71■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.71■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.71■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 KIF2CQ99661 725 aa25.71■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.7■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 LNPKQ9C0E8 428 aa25.7■■□□□ 1.71
PMS1-222ENST00000639501 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.7■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 KIF1BO60333 1816 aa25.69■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 CFAP53Q96M91 514 aa25.69■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 USP32Q8NFA0 1604 aa25.69■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 GBP4Q96PP9 640 aa25.67■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.67■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 NUCB1Q02818 461 aa25.66■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 NOS1P29475 1434 aa25.65■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.64■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.64■■□□□ 1.7
PMS1-222ENST00000639501 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 SSFA2P28290 1259 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 GGT6Q6P531 493 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-222ENST00000639501 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 TPM2P07951 284 aa25.58■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 AK9Q5TCS8 1911 aa25.58■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 ADGRB1O14514 1584 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 ABCC11Q96J66 1382 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 ADGRB3O60242 1522 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 KIF16BQ96L93 1317 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-222ENST00000639501 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 PTMSP20962 102 aa25.5■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 PPLO60437 1756 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 NSD2O96028 1365 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 MED14O60244 1454 aa25.48■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 RIPK4P57078 832 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 OFD1O75665 1012 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 CABP2Q9NPB3 220 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 IL16Q14005 1332 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.45■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.45■■□□□ 1.67
PMS1-222ENST00000639501 REREQ9P2R6 1566 aa25.45■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 ABCC3O15438 1527 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 A0A1W2PP64 1363 aa25.43■■□□□ 1.66
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