RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504015.2

ALYREF-201, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 254 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-201ENST00000504015 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 A2ML1A8K2U0 1454 aa5□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 NLRP1Q9C000 1473 aa5□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 CD163L1Q9NR16 1453 aa5□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 FAM135BQ49AJ0 1406 aa4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 FYB1O15117 783 aa4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 NEFMP07197 916 aa4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 PRAM1Q96QH2 718 aa4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 PLEKHF1Q96S99 279 aa4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 CDK19Q9BWU1 502 aa4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 CABP2Q9NPB3 220 aa4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 STAG3Q9UJ98 1225 aa4.99□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 TECPR2O15040 1411 aa4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 RIMS2Q9UQ26 1411 aa4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 TMPOP42166 694 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 ALDH1L2Q3SY69 923 aa4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 C8orf34Q49A92 452 aa4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 STK26Q9P289 416 aa4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 DMRT2Q9Y5R5 561 aa4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 AATKQ6ZMQ8 1374 aa4.98□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 KIF16BQ96L93 1317 aa4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 MON2Q7Z3U7 1717 aa4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 CPS1P31327 1500 aa4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
ALYREF-201ENST00000504015 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 WASLO00401 505 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 IGHDP01880 384 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 DEKP35659 375 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 LMOD3Q0VAK6 560 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 BECN1Q14457 450 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 NEUROD2Q15784 382 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 PANK1Q8TE04 598 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 ARHGAP45Q92619 1136 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 CABP1Q9NZU7 370 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 TRIM35Q9UPQ4 493 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 COG6Q9Y2V7 657 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 AKAP12Q02952 1782 aa4.96□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 ITSN1Q15811 1721 aa4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 TSPOAP1O95153 1857 aa4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 RIPK4P57078 832 aa4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 GNAI1P63096 354 aa4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 CCDC61Q9Y6R9 512 aa4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 UBR1Q8IWV7 1749 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 KIF24Q5T7B8 1368 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 LRRC7Q96NW7 1537 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 C3P01024 1663 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 SLC34A2O95436 690 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 RGS3P49796 1198 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 NBR1Q14596 966 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 NFE2L2Q16236 605 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 SMC5Q8IY18 1101 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 RSPH6AQ9H0K4 717 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 IFT57Q9NWB7 429 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 POLKQ9UBT6 870 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.94□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 TNRQ92752 1358 aa4.93□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 PIK3R4Q99570 1358 aa4.93□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 TMEM2Q9UHN6 1383 aa4.93□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 RLBP1P12271 317 aa4.93□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 TRIM27P14373 513 aa4.93□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 IL13P35225 146 aa4.93□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 NRKQ7Z2Y5 1582 aa4.93□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.93□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
ALYREF-201ENST00000504015 COG3Q96JB2 828 aa4.93□□□□□ -1.62
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