RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 RARSP54136 660 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.8■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 CPS1P31327 1500 aa35.79■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 SIRT1Q96EB6 747 aa35.77■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 CANXP27824 592 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 SKAP1Q86WV1 359 aa35.73■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.72■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 TMPOP42166 694 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.72■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.71■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.71■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 AAMPQ13685 434 aa35.7■■■■□ 3.31
CERS1-201ENST00000429504 AKAP12Q02952 1782 aa35.68■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.67■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 PANK1Q8TE04 598 aa35.67■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 CLUAP1Q96AJ1 413 aa35.67■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 IL16Q14005 1332 aa35.66■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.66■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 TRIM35Q9UPQ4 493 aa35.66■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 ITSN1Q15811 1721 aa35.66■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 COG6Q9Y2V7 657 aa35.64■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.64■■■■□ 3.3
CERS1-201ENST00000429504 POLKQ9UBT6 870 aa35.63■■■■□ 3.29
CERS1-201ENST00000429504 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CERS1-201ENST00000429504 FCHSD2O94868 740 aa35.61■■■■□ 3.29
CERS1-201ENST00000429504 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
CERS1-201ENST00000429504 C3P01024 1663 aa35.6■■■■□ 3.29
CERS1-201ENST00000429504 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.6■■■■□ 3.29
CERS1-201ENST00000429504 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
CERS1-201ENST00000429504 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.59■■■■□ 3.29
CERS1-201ENST00000429504 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
CERS1-201ENST00000429504 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.58■■■■□ 3.29
CERS1-201ENST00000429504 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.56■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 IGHDP01880 384 aa35.56■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 RIPK4P57078 832 aa35.56■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 FAM161AQ3B820 660 aa35.55■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 BCL2L13Q9BXK5 485 aa35.55■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 RLBP1P12271 317 aa35.54■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 RSPH6AQ9H0K4 717 aa35.53■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.52■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.51■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 NME9Q86XW9 330 aa35.51■■■■□ 3.28
CERS1-201ENST00000429504 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 C8orf34Q49A92 452 aa35.5■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa35.5■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.49■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 FBLN1P23142 703 aa35.48■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 RGS3P49796 1198 aa35.48■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 TNNQ9UQP3 1299 aa35.48■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 NEFMP07197 916 aa35.47■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 PRKAR2BP31323 418 aa35.47■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.47■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.46■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 COG3Q96JB2 828 aa35.46■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.45■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 MVPQ14764 893 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
CERS1-201ENST00000429504 SMC4Q9NTJ3 1288 aa35.44■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.44■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 LTKP29376 864 aa35.44■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 IL13P35225 146 aa35.44■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 SLIT1O75093 1534 aa35.43■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 DDRGK1Q96HY6 314 aa35.42■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa35.41■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.4■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 NFE2L2Q16236 605 aa35.4■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 SSH1Q8WYL5 1049 aa35.4■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.4■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.4■■■■□ 3.26
CERS1-201ENST00000429504 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.37■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 HMOX1P09601 288 aa35.35■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 TRIM27P14373 513 aa35.35■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 EID1Q9Y6B2 187 aa35.35■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 PHACTR3Q96KR7 559 aa35.34■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.34■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 KIF16BQ96L93 1317 aa35.34■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 PTPRUQ92729 1446 aa35.34■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa35.34■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 ZNF428Q96B54 188 aa35.34■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.33■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 ALDH1L2Q3SY69 923 aa35.33■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms