RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXD8-202ENST00000429017 ABCC5O15440 1437 aa10.37□□□□□ -0.75
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HOXD8-202ENST00000429017 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.75
HOXD8-202ENST00000429017 PTPREP23469 700 aa10.36□□□□□ -0.75
HOXD8-202ENST00000429017 WNT2BQ93097 391 aa10.36□□□□□ -0.75
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.36□□□□□ -0.75
HOXD8-202ENST00000429017 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
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HOXD8-202ENST00000429017 KIF15Q9NS87 1388 aa10.35□□□□□ -0.75
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HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa10.34□□□□□ -0.75
HOXD8-202ENST00000429017 SLIT1O75093 1534 aa10.34□□□□□ -0.75
HOXD8-202ENST00000429017 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.34□□□□□ -0.75
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HOXD8-202ENST00000429017 IDI1Q13907 227 aa10.29□□□□□ -0.76
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HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXD8-202ENST00000429017 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.29□□□□□ -0.76
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HOXD8-202ENST00000429017 NOS1P29475 1434 aa10.27□□□□□ -0.77
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HOXD8-202ENST00000429017 KANK1Q14678 1352 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.26□□□□□ -0.77
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HOXD8-202ENST00000429017 TMEM94Q12767 1356 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXD8-202ENST00000429017 ADGRL2O95490 1459 aa10.24□□□□□ -0.77
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HOXD8-202ENST00000429017 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
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HOXD8-202ENST00000429017 TBX22Q9Y458 520 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXD8-202ENST00000429017 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
HOXD8-202ENST00000429017 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
HOXD8-202ENST00000429017 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HOXD8-202ENST00000429017 WBP1LQ9NX94 342 aa10.12□□□□□ -0.79
HOXD8-202ENST00000429017 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.12□□□□□ -0.79
HOXD8-202ENST00000429017 PTPRUQ92729 1446 aa10.12□□□□□ -0.79
HOXD8-202ENST00000429017 LRP6O75581 1613 aa10.11□□□□□ -0.79
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