RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 IDI1Q13907 227 aa21.68■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 PRAM1Q96QH2 718 aa21.68■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.67■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.67■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 HMOX1P09601 288 aa21.67■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 HSCBQ8IWL3 235 aa21.65■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.65■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.64■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.64■■□□□ 1.05
SEPHS1-201ENST00000327347 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.64■■□□□ 1.05
SEPHS1-201ENST00000327347 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SEPHS1-201ENST00000327347 ARID3AQ99856 593 aa21.63■■□□□ 1.05
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SEPHS1-201ENST00000327347 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.63■■□□□ 1.05
SEPHS1-201ENST00000327347 TRAK2O60296 914 aa21.63■■□□□ 1.05
SEPHS1-201ENST00000327347 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.63■■□□□ 1.05
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.62■■□□□ 1.05
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SEPHS1-201ENST00000327347 PPLO60437 1756 aa21.61■■□□□ 1.05
SEPHS1-201ENST00000327347 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.6■■□□□ 1.05
SEPHS1-201ENST00000327347 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.6■■□□□ 1.05
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SEPHS1-201ENST00000327347 ABCC11Q96J66 1382 aa21.58■■□□□ 1.04
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SEPHS1-201ENST00000327347 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SEPHS1-201ENST00000327347 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.58■■□□□ 1.04
SEPHS1-201ENST00000327347 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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SEPHS1-201ENST00000327347 NUCB1Q02818 461 aa21.56■■□□□ 1.04
SEPHS1-201ENST00000327347 KIF16BQ96L93 1317 aa21.56■■□□□ 1.04
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SEPHS1-201ENST00000327347 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.54■■□□□ 1.04
SEPHS1-201ENST00000327347 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.54■■□□□ 1.04
SEPHS1-201ENST00000327347 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.54■■□□□ 1.04
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SEPHS1-201ENST00000327347 DCTN1Q14203 1278 aa21.5■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM83GA6ND36 823 aa21.49■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 USP32Q8NFA0 1604 aa21.49■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 FSD2A1L4K1 749 aa21.49■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 POLKQ9UBT6 870 aa21.49■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.49■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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SEPHS1-201ENST00000327347 IL16Q14005 1332 aa21.48■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.48■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.47■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 VAMP4O75379 141 aa21.47■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 FCHSD2O94868 740 aa21.47■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.46■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.46■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 MBIPQ9NS73 344 aa21.46■■□□□ 1.03
SEPHS1-201ENST00000327347 ERBB4Q15303 1308 aa21.45■■□□□ 1.03
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SEPHS1-201ENST00000327347 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.45■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.45■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.45■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 NME9Q86XW9 330 aa21.45■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.44■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 KIF2CQ99661 725 aa21.44■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.44■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.44■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.44■■□□□ 1.02
SEPHS1-201ENST00000327347 NFE2L2Q16236 605 aa21.43■■□□□ 1.02
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