RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTB-201ENST00000319942 EVC2Q86UK5 1308 aa13.75□□□□□ -0.21
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RABGGTB-201ENST00000319942 IFT172Q9UG01 1749 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRB1O14514 1584 aa13.73□□□□□ -0.21
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RABGGTB-201ENST00000319942 STK24Q9Y6E0 443 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 HRO43593 1189 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
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RABGGTB-201ENST00000319942 SIRT1Q96EB6 747 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAM1Q96QH2 718 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCC11Q96J66 1382 aa13.71□□□□□ -0.22
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RABGGTB-201ENST00000319942 TMC1Q8TDI8 760 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 LTKP29376 864 aa13.69□□□□□ -0.22
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RABGGTB-201ENST00000319942 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX22Q9Y458 520 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
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RABGGTB-201ENST00000319942 NLRP13Q86W25 1043 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.66□□□□□ -0.22
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RABGGTB-201ENST00000319942 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 METP08581 1390 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC184Q52MB2 194 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
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