RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 SMC5Q8IY18 1101 aa23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 PPLO60437 1756 aa23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.54■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.54■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.53■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.53■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 NSD2O96028 1365 aa23.52■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 GGT6Q6P531 493 aa23.52■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 CABP2Q9NPB3 220 aa23.52■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.52■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 MRE11P49959 708 aa23.51■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 RICTORQ6R327 1708 aa23.51■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 EVC2Q86UK5 1308 aa23.51■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.51■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.5■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.5■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 CLCN1P35523 988 aa23.5■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 NPATQ14207 1427 aa23.5■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 DDIT3P35638 169 aa23.49■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 LNPKQ9C0E8 428 aa23.49■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.48■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.48■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 GLI2P10070 1586 aa23.48■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.47■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 NUCB1Q02818 461 aa23.47■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 ABCC11Q96J66 1382 aa23.46■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 A0A1W2PP64 1363 aa23.45■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 RIPK4P57078 832 aa23.44■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 SNX21Q969T3 373 aa23.44■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.44■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 KIF16BQ96L93 1317 aa23.43■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 ABCC3O15438 1527 aa23.43■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.43■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 IL16Q14005 1332 aa23.42■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.42■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 DIP2BQ9P265 1576 aa23.41■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 ERBB4Q15303 1308 aa23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 KIF2CQ99661 725 aa23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.39■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 TSPOAP1O95153 1857 aa23.38■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.38■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.38■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.38■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 ESPNB1AK53 854 aa23.37■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 GBP4Q96PP9 640 aa23.37■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 FYB1O15117 783 aa23.36■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.36■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.35■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 STK26Q9P289 416 aa23.35■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.35■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.34■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 MED14O60244 1454 aa23.32■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.32■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.31■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 GCC1Q96CN9 775 aa23.29■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.28■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 SSFA2P28290 1259 aa23.28■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.28■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 PIK3C2BO00750 1634 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 PRKAR2BP31323 418 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CNIH3-201ENST00000272133 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.26■■□□□ 1.31
CNIH3-201ENST00000272133 FBLN1P23142 703 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms