RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 SDHBP21912 280 aa28.18■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 TCERG1LQ5VWI1 586 aa28.18■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 CYLDQ9NQC7 956 aa28.18■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 COQ4Q9Y3A0 265 aa28.18■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
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ODC1-204ENST00000446285 LMNB2Q03252 620 aa28.17■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 GOLGA8FQ08AF8 430 aa28.17■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa28.17■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 GAB4Q2WGN9 574 aa28.17■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 CEP68Q76N32 757 aa28.17■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
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ODC1-204ENST00000446285 ARHGAP8P85298 464 aa28.16■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 KLHDC10Q6PID8 442 aa28.16■■■□□ 2.1
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ODC1-204ENST00000446285 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.16■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 GAB3Q8WWW8 586 aa28.16■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 MYOFQ9NZM1 2061 aa28.15■■■□□ 2.1
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ODC1-204ENST00000446285 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 FOXR2Q6PJQ5 311 aa28.15■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa28.15■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
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ODC1-204ENST00000446285 PNKPQ96T60 521 aa28.15■■■□□ 2.1
ODC1-204ENST00000446285 USP18Q9UMW8 372 aa28.15■■■□□ 2.1
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ODC1-204ENST00000446285 KIF11P52732 1056 aa28.14■■■□□ 2.1
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ODC1-204ENST00000446285 CBWD5Q5RIA9 395 aa28.14■■■□□ 2.1
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ODC1-204ENST00000446285 CYP26A1O43174 497 aa28.13■■■□□ 2.09
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ODC1-204ENST00000446285 SLC8A3P57103 927 aa28.13■■■□□ 2.09
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ODC1-204ENST00000446285 ZNF276Q8N554 614 aa28.13■■■□□ 2.09
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ODC1-204ENST00000446285 GRIA2P42262 883 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 PGFP49763 221 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 CUL2Q13617 745 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 BBS7Q8IWZ6 715 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
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