RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C APE3P37302 537 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C IRC4Q03036 179 aa8.73□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C TOS4Q06266 489 aa8.73□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C PSF3Q12146 194 aa8.73□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C SUP35P05453 685 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C MAC1P35192 417 aa8.72□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C NUG1P40010 520 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C YJL171CP46992 396 aa8.72□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C SRC1Q03707 834 aa8.72□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C RPS7AP26786 190 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C RBA50Q04418 439 aa8.71□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C ADR1P07248 1323 aa8.71□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C UBP12P39538 1254 aa8.7□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C NIT1P40447 199 aa8.7□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C PIB1Q06651 286 aa8.7□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C VPS13Q07878 3144 aa8.7□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C TAO3P40468 2376 aa8.69□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C GAL2P13181 574 aa8.69□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C JJJ2P46997 583 aa8.69□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C YGR122WP53272 402 aa8.69□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C SWC3P31376 625 aa8.66□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C HXT10P43581 546 aa8.66□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C RAD24P32641 659 aa8.65□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SPE3YPR069C RPP0P05317 312 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C BOI2P39969 1040 aa8.64□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C YFH7P43591 353 aa8.64□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C YPP1P46951 817 aa8.64□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C ASH1P34233 588 aa8.63□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C PUS6P53294 404 aa8.63□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C SUI2P20459 304 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C GLO3P38682 493 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C PPM2Q08282 695 aa8.62□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C GIN4Q12263 1142 aa8.62□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C RPS19AP07280 144 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C SNF3P10870 884 aa8.61□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C RAD53P22216 821 aa8.61□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C SPR3P41901 512 aa8.61□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C JIP4Q03361 876 aa8.61□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C FLO1P32768 1537 aa8.6□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data8.6□□□□□ -1.03not detected
SPE3YPR069C RPT3P33298 428 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C PAM1P37304 830 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C KEL1P38853 1164 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C SGD1Q06132 899 aa8.6□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C YPR117WQ06116 2489 aa8.6□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C TPS3P38426 1054 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C APL6P46682 809 aa8.59□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C CSI1Q04368 295 aa8.59□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SPE3YPR069C MRPL32P25348 183 aa8.58□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C VPS27P40343 622 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C GYP5Q12344 894 aa8.58□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C SEC18P18759 758 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C NET1P47035 1189 aa8.57□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C PIF1P07271 859 aa8.56□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C ADP1P25371 1049 aa8.56□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C HAL5P38970 855 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C PMA1P05030 918 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C PEX29Q03370 554 aa8.55□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C ECM29P38737 1868 aa8.55□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C ERG7P38604 731 aa8.54□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C YIR042CP40586 236 aa8.54□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C NOP2P40991 618 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C INM2Q05533 292 aa8.54□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C PCL8Q08966 492 aa8.54□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C OCT1P35999 772 aa8.53□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C MAL31P38156 614 aa8.53□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C MSH4P40965 878 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C HGH1P48362 394 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SPE3YPR069C AI2P03876 854 aa8.52□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C PAH1P32567 862 aa8.52□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C CDC45Q08032 650 aa8.52□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C RRI2Q12348 645 aa8.52□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C KIN1P13185 1064 aa8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C SLA1P32790 1244 aa8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C MDL2P33311 773 aa8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C IXR1P33417 597 aa8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C PSF2P40359 213 aa8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C YNL193WP53870 558 aa8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C NSG2P53898 299 aa8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C ULP1Q02724 621 aa8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C TY3A-GQ12173 290 aa8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C TY3A-IQ99219 290 aa8.51□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C CYB2P00175 591 aa8.5□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C GCD7P32502 381 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C ACA1P39970 489 aa8.5□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data8.5□□□□□ -1.05not detected
SPE3YPR069C RPN7Q06103 429 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C TUB2P02557 457 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SPE3YPR069C YDJ1P25491 409 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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