RNA–Protein interactions for RNA: YMR019W

STB4, Transcript of Putative transcription factor, yeast

Gene STB4, Length 2,850 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB4	YMR019W	MTO1	P53070	669 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	CDC55	Q00362	526 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	DAL1	P32375	460 aa		3.01	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	QDR2	P40474	542 aa		3.01	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	RMD1	Q03441	430 aa		3.01	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	MLF3	P32047	452 aa		3.01	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	DLD1	P32891	587 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	GIP1	P38229	639 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	SSN3	P39073	555 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	CLA4	P48562	842 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	UBP15	P50101	1230 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	BSC2	Q05611	235 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	FRT1	Q99332	602 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	CLN2	P20438	545 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	RPB10	P22139	70 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	NTA1	P40354	457 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	YJR098C	P47139	656 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	RSC2	Q06488	889 aa		3	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	PEP7	P32609	515 aa		2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	SEC8	P32855	1065 aa		2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	YHL008C	P38750	627 aa		2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	BRE2	P43132	505 aa		2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	YOR296W	Q08748	1289 aa		2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	WHI5	Q12416	295 aa		2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	AIM46	P38885	310 aa		2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	MAD1	P40957	749 aa		2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	TCB1	Q12466	1186 aa		2.99	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	YJR107W	P47145	328 aa		2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	RSC4	Q02206	625 aa		2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	MSN1	P22148	382 aa		2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	MET4	P32389	672 aa		2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	PSY2	P40164	858 aa		2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	ALD2	P47771	506 aa		2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	SCW11	P53189	542 aa		2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	RGP1	P16664	663 aa		2.97	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	ATE1	P16639	503 aa		2.97	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	SHU2	P38957	223 aa		2.97	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	NNF1	P47149	201 aa		2.97	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	HEH2	Q03281	663 aa		2.97	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	YCS4	Q06156	1176 aa		2.97	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	MET1	P36150	593 aa		2.96	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	APM2	P38700	605 aa		2.96	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	MRPS18	P42847	217 aa		2.96	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	YNL165W	P53891	406 aa		2.96	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	MCD1	Q12158	566 aa		2.96	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	PSH1	Q12161	406 aa		2.96	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	YGR122W	P53272	402 aa		2.96	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	STB3	Q12427	513 aa		2.96	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	MNR2	P35724	969 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	DAK2	P43550	591 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	CWC24	P53769	259 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	RPC31	P17890	251 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	SCT1	P32784	759 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	SLA1	P32790	1244 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	SQT1	P35184	431 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	MRPL16	P38064	232 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	SKP1	P52286	194 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	PMT7	Q06644	662 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	MNL2	Q12205	849 aa		2.95	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	PET112	P33893	541 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	OSH7	P38755	437 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	RGD2	P43556	714 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	FPS1	P23900	669 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	RAD27	P26793	382 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	ATG14	P38270	344 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	BSD2	P38356	321 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	DAL4	Q04895	635 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	OPT2	Q06593	877 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	GPI13	Q07830	1017 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	FLP1	P03870	423 aa		2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.94	□□□□□ -1.94	not detected
STB4	YMR019W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.94	□□□□□ -1.94	not detected
STB4	YMR019W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
STB4	YMR019W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94

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