RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	KEX2	P13134	814 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	SEC2	P17065	759 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	KCC4	P25389	1037 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	ALE1	Q08548	619 aa		7.55	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	UGA3	P26370	528 aa		7.54	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	YGR122W	P53272	402 aa		7.54	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	YNL115C	P53925	644 aa		7.54	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	CSI1	Q04368	295 aa		7.54	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	NSE3	Q05541	303 aa		7.54	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	SIT4	P20604	311 aa		7.53	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	YKL133C	P36066	463 aa		7.53	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	LYS2	P07702	1392 aa		7.53	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	RAS1	P01119	309 aa		7.52	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	RAD4	P14736	754 aa		7.52	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	SDH2	P21801	266 aa		7.52	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	RRN7	P40992	514 aa		7.52	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	ZDS2	P54786	942 aa		7.52	□□□□□ -1.2
YCK1	YHR135C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	RAD24	P32641	659 aa		7.52	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	YPP1	P46951	817 aa		7.52	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	NIS1	P53939	407 aa		7.52	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	MEC3	Q02574	474 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	SPO1	P53541	631 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	ERF2	Q06551	359 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	YOL057W	Q08225	711 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	AIM7	Q12156	149 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	GLC3	P32775	704 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	ATG13	Q06628	738 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	MRP7	P12687	371 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	SWC3	P31376	625 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	DOT5	P40553	215 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	FPK1	P53739	893 aa		7.49	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	YBP2	P53169	641 aa		7.48	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	YDR306C	Q06640	478 aa		7.48	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	COB	P00163	385 aa		7.47	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	RMT2	Q03305	412 aa		7.46	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
YCK1	YHR135C	NUP133	P36161	1157 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	SWI1	P09547	1314 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	SLY41	P22215	453 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	YKR075C	P36155	307 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	BOI2	P39969	1040 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	TUB4	P53378	473 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	HST2	P53686	357 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	VPS64	Q03944	604 aa		7.45	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	OPY1	P38271	328 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	CST6	P40535	587 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	DNM1	P54861	757 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	NKP2	Q06162	153 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	MMP1	Q12372	583 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	AGE1	Q04412	482 aa		7.41	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	LAM6	Q08001	693 aa		7.41	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	KXD1	P53158	218 aa		7.41	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	SRC1	Q03707	834 aa		7.41	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	PUS6	P53294	404 aa		7.4	□□□□□ -1.22
YCK1	YHR135C	RAD50	P12753	1312 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	ARG8	P18544	423 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	BDP1	P46678	594 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	TBF1	Q02457	562 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	SSP2	Q08646	371 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	YPR204W	Q08995	1032 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	YIR014W	P40570	242 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	YJR008W	P47085	338 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	UBP12	P39538	1254 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	HXT10	P43581	546 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	FCP1	Q03254	732 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	IME2	P32581	645 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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