RNA–Protein interactions for RNA: YBL005W

PDR3, Transcript of Transcriptional activator of the pleiotropic drug resistance network, yeast

Gene PDR3, Length 2,931 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR3	YBL005W	FLO1	P32768	1537 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PRD1	P25375	712 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	FMP30	Q02883	468 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	TRK1	P12685	1235 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	YJL171C	P46992	396 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	ARG82	P07250	355 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	DIT2	P21595	489 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	NPL4	P33755	580 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	GEF1	P37020	779 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	NET1	P47035	1189 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PKH1	Q03407	766 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	COQ4	O13525	335 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	AFG2	P32794	780 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PES4	P39684	611 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	NIT1	P40447	199 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	CBP1	P07252	654 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	MGA2	P40578	1113 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	VPS64	Q03944	604 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	ICL2	Q12031	575 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PIF1	P07271	859 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	MRP7	P12687	371 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	AIM21	P40563	679 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	YAF9	P53930	226 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	SRC1	Q03707	834 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	ERG7	P38604	731 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	ECM30	Q06673	1274 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	GIN4	Q12263	1142 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	MGM1	P32266	881 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	SET4	P42948	560 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	JJJ2	P46997	583 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PIB1	Q06651	286 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PER1	P25625	357 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	VAB2	P40003	282 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	VPS4	P52917	437 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	ITC1	P53125	1264 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PSH1	Q12161	406 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	FLO11	P08640	1367 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PAH1	P32567	862 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	LYS14	P40971	790 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	APL6	P46682	809 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	CLA4	P48562	842 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	JIP4	Q03361	876 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	OCT1	P35999	772 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	STV1	P37296	890 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	MAL31	P38156	614 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	MXR1	P40029	184 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	YPP1	P46951	817 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	THI3	Q07471	609 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PCL8	Q08966	492 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	ASH1	P34233	588 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	SPL2	P38839	148 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	YFH7	P43591	353 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	MTC3	P53077	123 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	PPM2	Q08282	695 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
PDR3	YBL005W	CYB2	P00175	591 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	MPH3	P0CE00	602 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	SGD1	Q06132	899 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	TUS1	Q06412	1307 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	FBP1	P09201	348 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	TIM23	P32897	222 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	NUP133	P36161	1157 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	IRC4	Q03036	179 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	THI22	Q06490	572 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	GAS5	Q08193	484 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	MST1	P07236	462 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	YKR018C	P36114	725 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	LDH1	P38139	375 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	MSC7	P38694	644 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	SRT1	Q03175	343 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PDR3	YBL005W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91

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