RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	RSC6	P25632	483 aa		9.04	□□□□□ -0.96
VAR1	Q0140	CHS2	P14180	963 aa		9.03	□□□□□ -0.96
VAR1	Q0140	YPP1	P46951	817 aa		9.03	□□□□□ -0.96
VAR1	Q0140	SKP1	P52286	194 aa		9.03	□□□□□ -0.96
VAR1	Q0140	MRP10	O75012	95 aa		9	□□□□□ -0.97
VAR1	Q0140	YNR040W	P53736	256 aa		8.98	□□□□□ -0.97
VAR1	Q0140	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	8.98	□□□□□ -0.97
VAR1	Q0140	NTH2	P35172	780 aa		8.97	□□□□□ -0.97
VAR1	Q0140	CYC7	P00045	113 aa		8.96	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	KIN1	P13185	1064 aa		8.95	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	8.95	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	AKR1	P39010	764 aa		8.95	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	8.95	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	8.94	□□□□□ -0.98	not detected
VAR1	Q0140	APM2	P38700	605 aa		8.92	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	YFL034W	P43564	1073 aa		8.92	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	SLP1	Q12232	587 aa		8.92	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	YCR015C	P25616	317 aa		8.91	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	SPO74	P45819	413 aa		8.91	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	YKL222C	P35995	705 aa		8.9	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98
VAR1	Q0140	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		8.89	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	8.89	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		8.89	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	BIO2	P32451	375 aa		8.88	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	TED1	P40533	473 aa		8.88	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	8.87	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	8.87	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	SEG2	P34250	1132 aa		8.87	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	IDI1	P15496	288 aa		8.86	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	SEA4	P38164	1038 aa		8.86	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	KAP122	P32767	1081 aa		8.85	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	GIS1	Q03833	894 aa		8.85	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	8.84	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	8.84	□□□□□ -0.99
VAR1	Q0140	REC8	Q12188	680 aa		8.83	□□□□□ -1
VAR1	Q0140	LRG1	P35688	1017 aa		8.82	□□□□□ -1
VAR1	Q0140	YNL108C	P53929	270 aa		8.82	□□□□□ -1
VAR1	Q0140	CYT1	P07143	309 aa		8.81	□□□□□ -1
VAR1	Q0140	GIP2	P40036	548 aa		8.81	□□□□□ -1
VAR1	Q0140	RIM21	P48565	533 aa		8.81	□□□□□ -1
VAR1	Q0140	RPC31	P17890	251 aa		8.8	□□□□□ -1
VAR1	Q0140	NIT1	P40447	199 aa		8.76	□□□□□ -1.01
VAR1	Q0140	DSE4	P53753	1117 aa		8.76	□□□□□ -1.01
VAR1	Q0140	SDH1	Q00711	640 aa		8.76	□□□□□ -1.01
VAR1	Q0140	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	8.75	□□□□□ -1.01
VAR1	Q0140	TSC13	Q99190	310 aa		8.75	□□□□□ -1.01
VAR1	Q0140	ESC8	Q08119	714 aa		8.74	□□□□□ -1.01
VAR1	Q0140	PKC1	P24583	1151 aa		8.73	□□□□□ -1.01
VAR1	Q0140	SCD5	P34758	872 aa		8.72	□□□□□ -1.01
VAR1	Q0140	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	8.72	□□□□□ -1.01
VAR1	Q0140	ITC1	P53125	1264 aa		8.72	□□□□□ -1.01
VAR1	Q0140	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	8.71	□□□□□ -1.02
VAR1	Q0140	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	8.71	□□□□□ -1.02
VAR1	Q0140	BRL1	P38770	471 aa		8.71	□□□□□ -1.02
VAR1	Q0140	HXT5	P38695	592 aa		8.69	□□□□□ -1.02
VAR1	Q0140	TAF1	P46677	1066 aa		8.69	□□□□□ -1.02
VAR1	Q0140	ECL1	P48235	211 aa		8.67	□□□□□ -1.02
VAR1	Q0140	QDR2	P40474	542 aa		8.66	□□□□□ -1.02
VAR1	Q0140	DFG16	Q99234	619 aa		8.63	□□□□□ -1.03
VAR1	Q0140	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	8.62	□□□□□ -1.03
VAR1	Q0140	GIP4	P39732	760 aa		8.62	□□□□□ -1.03
VAR1	Q0140	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	8.62	□□□□□ -1.03
VAR1	Q0140	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	8.6	□□□□□ -1.03
VAR1	Q0140	UBP1	P25037	809 aa		8.58	□□□□□ -1.04
VAR1	Q0140	YJL181W	P46987	611 aa		8.57	□□□□□ -1.04
VAR1	Q0140	PAN5	P38787	379 aa		8.56	□□□□□ -1.04
VAR1	Q0140	MRX10	Q05648	414 aa		8.56	□□□□□ -1.04
VAR1	Q0140	NCE103	P53615	221 aa		8.55	□□□□□ -1.04
VAR1	Q0140	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	8.54	□□□□□ -1.04
VAR1	Q0140	YHL008C	P38750	627 aa		8.53	□□□□□ -1.04
VAR1	Q0140	YOR296W	Q08748	1289 aa		8.53	□□□□□ -1.04
VAR1	Q0140	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	8.51	□□□□□ -1.05
VAR1	Q0140	CDA2	Q06703	312 aa		8.51	□□□□□ -1.05
VAR1	Q0140	RSC2	Q06488	889 aa		8.5	□□□□□ -1.05
VAR1	Q0140	PPT1	P53043	513 aa		8.49	□□□□□ -1.05
VAR1	Q0140	BSD2	P38356	321 aa		8.48	□□□□□ -1.05
VAR1	Q0140	PEP12	P32854	288 aa		8.46	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	8.46	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	YNR065C	P53751	1116 aa		8.46	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	THI80	P35202	319 aa		8.45	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	8.45	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	8.44	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	GIC2	Q06648	383 aa		8.44	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	PHO87	P25360	923 aa		8.42	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	GIP1	P38229	639 aa		8.42	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	GAS4	Q08271	471 aa		8.42	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	HDA2	Q06629	674 aa		8.41	□□□□□ -1.06
VAR1	Q0140	VMA3	P25515	160 aa		8.39	□□□□□ -1.07
VAR1	Q0140	YJL007C	P47080	104 aa		8.39	□□□□□ -1.07
VAR1	Q0140	GUP1	P53154	560 aa		8.39	□□□□□ -1.07
VAR1	Q0140	KTR7	P40504	517 aa		8.38	□□□□□ -1.07
VAR1	Q0140	HAP4	P14064	554 aa		8.37	□□□□□ -1.07
VAR1	Q0140	HSP78	P33416	811 aa		8.37	□□□□□ -1.07
VAR1	Q0140	FLR1	P38124	548 aa		8.37	□□□□□ -1.07
VAR1	Q0140	DYS1	P38791	387 aa		8.37	□□□□□ -1.07
VAR1	Q0140	YIL165C	P40446	119 aa		8.37	□□□□□ -1.07
VAR1	Q0140	LEM3	P42838	414 aa		8.37	□□□□□ -1.07
VAR1	Q0140	CAB1	Q04430	367 aa		8.37	□□□□□ -1.07

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