RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
PTPRVP-201ENST00000482597 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRVP-201ENST00000482597 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRVP-201ENST00000482597 ZMYM3Q14202 1370 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRVP-201ENST00000482597 WASLO00401 505 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
PTPRVP-201ENST00000482597 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
PTPRVP-201ENST00000482597 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
PTPRVP-201ENST00000482597 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 FOXO3O43524 673 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 ERICH6BQ5W0A0 696 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 TNRQ92752 1358 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 MS4A1P11836 297 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 USP35Q9P2H5 1018 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 NPATQ14207 1427 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 DCTN1Q14203 1278 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 STK31Q9BXU1 1019 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 NGEFQ8N5V2 710 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF428Q96B54 188 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 LMOD3Q0VAK6 560 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 SKAP1Q86WV1 359 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 NLRP2Q9NX02 1062 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 PLA2R1Q13018 1463 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 FYB1O15117 783 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 HSPA2P54652 639 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 WWC1Q8IX03 1113 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 TEFQ10587 303 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRVP-201ENST00000482597 RIMS2Q9UQ26 1411 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 ABCC1P33527 1531 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 EVA1CP58658 441 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 ACEP12821 1306 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP10AO60312 1499 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 TMPOP42166 694 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 TSPOAP1O95153 1857 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 PREX2Q70Z35 1606 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 LTKP29376 864 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNA6P17658 529 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 GPRASP1Q5JY77 1395 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 SLFN5Q08AF3 891 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 MCM10Q7L590 875 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 NEO1Q92859 1461 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 GNAI1P63096 354 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 STRN4Q9NRL3 753 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 ADCY10Q96PN6 1610 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM83GA6ND36 823 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf115Q9H7X2 142 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 MSH5O43196 834 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC4A3P48751 1232 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD45Q5TZF3 282 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRVP-201ENST00000482597 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 PDE4AP27815 886 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 FCHSD2O94868 740 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 ARID3AQ99856 593 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.1 ms