RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424350.5

ANKRD54-206, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-206ENST00000424350 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54-206ENST00000424350 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54-206ENST00000424350 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54-206ENST00000424350 PXDNQ92626 1479 aa25.61■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.61■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 FOXO3O43524 673 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 HFM1A2PYH4 1435 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 CLTCL1P53675 1640 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 GLI3P10071 1580 aa25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54-206ENST00000424350 LRP5O75197 1615 aa25.57■■□□□ 1.68
ANKRD54-206ENST00000424350 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
ANKRD54-206ENST00000424350 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
ANKRD54-206ENST00000424350 ITGAEP38570 1179 aa25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54-206ENST00000424350 SLIT2O94813 1529 aa25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54-206ENST00000424350 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.54■■□□□ 1.68
ANKRD54-206ENST00000424350 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
ANKRD54-206ENST00000424350 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54-206ENST00000424350 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54-206ENST00000424350 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54-206ENST00000424350 KIF1BO60333 1816 aa25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54-206ENST00000424350 NUTM2FA1L443 756 aa25.49■■□□□ 1.67
ANKRD54-206ENST00000424350 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.47■■□□□ 1.67
ANKRD54-206ENST00000424350 HRCP23327 699 aa25.47■■□□□ 1.67
ANKRD54-206ENST00000424350 VPS72Q15906 364 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54-206ENST00000424350 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54-206ENST00000424350 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54-206ENST00000424350 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54-206ENST00000424350 NAIPQ13075 1403 aa25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54-206ENST00000424350 BAG6P46379 1132 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-206ENST00000424350 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54-206ENST00000424350 USP32Q8NFA0 1604 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54-206ENST00000424350 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-206ENST00000424350 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54-206ENST00000424350 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54-206ENST00000424350 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-206ENST00000424350 STK26Q9P289 416 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54-206ENST00000424350 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54-206ENST00000424350 A0A0G2JS52 829 aa25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54-206ENST00000424350 PLEKHG5O94827 1062 aa25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54-206ENST00000424350 MYT1Q01538 1121 aa25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54-206ENST00000424350 PPLO60437 1756 aa25.34■■□□□ 1.65
ANKRD54-206ENST00000424350 TECPR2O15040 1411 aa25.33■■□□□ 1.65
ANKRD54-206ENST00000424350 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
ANKRD54-206ENST00000424350 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.32■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.32■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 KIF1AQ12756 1690 aa25.32■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.32■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.32■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 PSME1Q06323 249 aa25.31■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.3■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 ABCC11Q96J66 1382 aa25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 FAM83GA6ND36 823 aa25.28■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.28■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-206ENST00000424350 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-206ENST00000424350 SBNO1A3KN83 1393 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-206ENST00000424350 FAM182BQ5T319 152 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-206ENST00000424350 ARHGEF10O15013 1369 aa25.23■■□□□ 1.63
ANKRD54-206ENST00000424350 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-206ENST00000424350 BTG4Q9NY30 223 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-206ENST00000424350 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-206ENST00000424350 ABCA3Q99758 1704 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-206ENST00000424350 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.2■■□□□ 1.63
ANKRD54-206ENST00000424350 YY1P25490 414 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 DISP2A7MBM2 1401 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 RGL3Q3MIN7 710 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 NRAPQ86VF7 1730 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 SIRT1Q96EB6 747 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.14■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.14■■□□□ 1.62
ANKRD54-206ENST00000424350 IFT172Q9UG01 1749 aa25.14■■□□□ 1.61
ANKRD54-206ENST00000424350 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.13■■□□□ 1.61
ANKRD54-206ENST00000424350 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.13■■□□□ 1.61
ANKRD54-206ENST00000424350 PIK3C2GO75747 1445 aa25.12■■□□□ 1.61
ANKRD54-206ENST00000424350 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ANKRD54-206ENST00000424350 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54-206ENST00000424350 TRIM37O94972 964 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-206ENST00000424350 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-206ENST00000424350 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-206ENST00000424350 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-206ENST00000424350 ADGRB2O60241 1585 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-206ENST00000424350 APBA3O96018 575 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-206ENST00000424350 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-206ENST00000424350 PRAM1Q96QH2 718 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-206ENST00000424350 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms