RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424350.5

ANKRD54-206, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-206ENST00000424350 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.85■■■■■ 4.45
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ANKRD54-206ENST00000424350 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.89■■■■□ 3.66
ANKRD54-206ENST00000424350 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.29■■■■□ 3.56
ANKRD54-206ENST00000424350 NACADO15069 1562 aa36.84■■■■□ 3.49
ANKRD54-206ENST00000424350 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
ANKRD54-206ENST00000424350 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.6■■■■□ 3.45
ANKRD54-206ENST00000424350 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.39■■■■□ 3.42
ANKRD54-206ENST00000424350 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.23■■■■□ 3.39
ANKRD54-206ENST00000424350 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.07■■■■□ 3.36
ANKRD54-206ENST00000424350 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.74■■■■□ 3.31
ANKRD54-206ENST00000424350 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.68■■■■□ 3.3
ANKRD54-206ENST00000424350 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.65■■■■□ 3.3
ANKRD54-206ENST00000424350 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
ANKRD54-206ENST00000424350 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.35■■■■□ 3.25
ANKRD54-206ENST00000424350 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
ANKRD54-206ENST00000424350 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.32■■■■□ 3.25
ANKRD54-206ENST00000424350 SCRIBQ14160 1630 aa35.28■■■■□ 3.24
ANKRD54-206ENST00000424350 CUX2O14529 1486 aa34.42■■■■□ 3.1
ANKRD54-206ENST00000424350 ERCC6Q03468 1493 aa34.23■■■■□ 3.07
ANKRD54-206ENST00000424350 NCAPD3P42695 1498 aa34.06■■■■□ 3.04
ANKRD54-206ENST00000424350 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.85■■■■□ 3.01
ANKRD54-206ENST00000424350 NESP48681 1621 aa33.78■■■■□ 3
ANKRD54-206ENST00000424350 HMGXB3Q12766 1538 aa33.69■■■□□ 2.98
ANKRD54-206ENST00000424350 SMARCA2P51531 1590 aa33.67■■■□□ 2.98
ANKRD54-206ENST00000424350 SMARCA4P51532 1647 aa33.57■■■□□ 2.97
ANKRD54-206ENST00000424350 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
ANKRD54-206ENST00000424350 TRIM41Q8WV44 630 aa33.5■■■□□ 2.95
ANKRD54-206ENST00000424350 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
ANKRD54-206ENST00000424350 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.38■■■□□ 2.93
ANKRD54-206ENST00000424350 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
ANKRD54-206ENST00000424350 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.26■■■□□ 2.91
ANKRD54-206ENST00000424350 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.25■■■□□ 2.91
ANKRD54-206ENST00000424350 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.25■■■□□ 2.91
ANKRD54-206ENST00000424350 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.02■■■□□ 2.88
ANKRD54-206ENST00000424350 MRC2Q9UBG0 1479 aa33■■■□□ 2.87
ANKRD54-206ENST00000424350 CADPSQ9ULU8 1353 aa33■■■□□ 2.87
ANKRD54-206ENST00000424350 WDR62O43379 1518 aa32.92■■■□□ 2.86
ANKRD54-206ENST00000424350 OSCARQ8IYS5 282 aa32.77■■■□□ 2.84
ANKRD54-206ENST00000424350 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.71■■■□□ 2.83
ANKRD54-206ENST00000424350 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.61■■■□□ 2.81
ANKRD54-206ENST00000424350 WIZO95785 1651 aa32.56■■■□□ 2.8
ANKRD54-206ENST00000424350 CFTRP13569 1480 aa32.44■■■□□ 2.78
ANKRD54-206ENST00000424350 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
ANKRD54-206ENST00000424350 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.37■■■□□ 2.77
ANKRD54-206ENST00000424350 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.37■■■□□ 2.77
ANKRD54-206ENST00000424350 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.37■■■□□ 2.77
ANKRD54-206ENST00000424350 ARHGEF11O15085 1522 aa32.21■■■□□ 2.75
ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
ANKRD54-206ENST00000424350 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
ANKRD54-206ENST00000424350 IFT140Q96RY7 1462 aa32.1■■■□□ 2.73
ANKRD54-206ENST00000424350 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.08■■■□□ 2.73
ANKRD54-206ENST00000424350 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
ANKRD54-206ENST00000424350 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
ANKRD54-206ENST00000424350 PRDM2Q13029 1718 aa31.94■■■□□ 2.7
ANKRD54-206ENST00000424350 TOPBP1Q92547 1522 aa31.9■■■□□ 2.7
ANKRD54-206ENST00000424350 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
ANKRD54-206ENST00000424350 ARAP1Q96P48 1450 aa31.84■■■□□ 2.69
ANKRD54-206ENST00000424350 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.78■■■□□ 2.68
ANKRD54-206ENST00000424350 ABCC8Q09428 1581 aa31.77■■■□□ 2.68
ANKRD54-206ENST00000424350 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.76■■■□□ 2.67
ANKRD54-206ENST00000424350 CHD1O14646 1710 aa31.75■■■□□ 2.67
ANKRD54-206ENST00000424350 FBLN2P98095 1184 aa31.74■■■□□ 2.67
ANKRD54-206ENST00000424350 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.69■■■□□ 2.66
ANKRD54-206ENST00000424350 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
ANKRD54-206ENST00000424350 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
ANKRD54-206ENST00000424350 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
ANKRD54-206ENST00000424350 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
ANKRD54-206ENST00000424350 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.45■■■□□ 2.62
ANKRD54-206ENST00000424350 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.41■■■□□ 2.62
ANKRD54-206ENST00000424350 SOGA1O94964 1423 aa31.4■■■□□ 2.62
ANKRD54-206ENST00000424350 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.39■■■□□ 2.62
ANKRD54-206ENST00000424350 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
ANKRD54-206ENST00000424350 SYNJ1O43426 1573 aa31.31■■■□□ 2.6
ANKRD54-206ENST00000424350 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
ANKRD54-206ENST00000424350 WDR97A6NE52 1622 aa31.24■■■□□ 2.59
ANKRD54-206ENST00000424350 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.21■■■□□ 2.59
ANKRD54-206ENST00000424350 GRIN2BQ13224 1484 aa31.19■■■□□ 2.58
ANKRD54-206ENST00000424350 SYNJ2O15056 1496 aa31.18■■■□□ 2.58
ANKRD54-206ENST00000424350 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.17■■■□□ 2.58
ANKRD54-206ENST00000424350 CUX1P39880 1505 aa31.06■■■□□ 2.56
ANKRD54-206ENST00000424350 PBRM1Q86U86 1689 aa30.94■■■□□ 2.54
ANKRD54-206ENST00000424350 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.89■■■□□ 2.54
ANKRD54-206ENST00000424350 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.81■■■□□ 2.52
ANKRD54-206ENST00000424350 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.8■■■□□ 2.52
ANKRD54-206ENST00000424350 GRIN2AQ12879 1464 aa30.78■■■□□ 2.52
ANKRD54-206ENST00000424350 CEP170Q5SW79 1584 aa30.75■■■□□ 2.51
ANKRD54-206ENST00000424350 NUP160Q12769 1436 aa30.72■■■□□ 2.51
ANKRD54-206ENST00000424350 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.64■■■□□ 2.5
ANKRD54-206ENST00000424350 ADAMTS12P58397 1594 aa30.63■■■□□ 2.49
ANKRD54-206ENST00000424350 SHROOM2Q13796 1616 aa30.62■■■□□ 2.49
ANKRD54-206ENST00000424350 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.56■■■□□ 2.48
ANKRD54-206ENST00000424350 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.56■■■□□ 2.48
ANKRD54-206ENST00000424350 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
ANKRD54-206ENST00000424350 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.51■■■□□ 2.47
ANKRD54-206ENST00000424350 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.44■■■□□ 2.46
ANKRD54-206ENST00000424350 JPH4Q96JJ6 628 aa30.44■■■□□ 2.46
ANKRD54-206ENST00000424350 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.4■■■□□ 2.46
ANKRD54-206ENST00000424350 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.46
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