RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364043.1

SNORD46-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 46, humanhuman

BASIC

Gene SNORD46, Length 104 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD46-201ENST00000364043 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 ORAI2Q96SN7 254 aa12□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 PCGF6Q9BYE7 350 aa12□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 SPON1Q9HCB6 807 aa11.99□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.99□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.99□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.99□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.98□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 KIF15Q9NS87 1388 aa11.98□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 VPS72Q15906 364 aa11.98□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 FAM182BQ5T319 152 aa11.98□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 UTRNP46939 3433 aa11.98□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.97□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 ADGRB2O60241 1585 aa11.97□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 A0A0G2JS52 829 aa11.97□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 MYT1Q01538 1121 aa11.97□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.97□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 KCNQ2O43526 872 aa11.96□□□□□ -0.49
SNORD46-201ENST00000364043 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.95□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.94□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 CHD4Q14839 1912 aa11.94□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 CAPN15O75808 1086 aa11.93□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 PXDNQ92626 1479 aa11.93□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 ADGRL2O95490 1459 aa11.92□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 USP32Q8NFA0 1604 aa11.92□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.91□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.91□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 NBPF14Q5TI25 921 aa11.91□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.9□□□□□ -0.5
SNORD46-201ENST00000364043 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.89□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.89□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 SLC34A2O95436 690 aa11.89□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 RREB1Q92766 1687 aa11.89□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 TRIM37O94972 964 aa11.88□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 APBA3O96018 575 aa11.88□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.87□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.87□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 METP08581 1390 aa11.87□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 FOXO3O43524 673 aa11.86□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 PLEKHG5O94827 1062 aa11.86□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 NRKQ7Z2Y5 1582 aa11.85□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.85□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.84□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 CROCC2H7BZ55 1655 aa11.84□□□□□ -0.51
SNORD46-201ENST00000364043 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.82□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.82□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 SYT17Q9BSW7 474 aa11.82□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.82□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.82□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa11.81□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.81□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.8□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 ABCC5O15440 1437 aa11.8□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 ZBTB7AO95365 584 aa11.8□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.8□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 MYOM1P52179 1685 aa11.8□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 FAM83GA6ND36 823 aa11.79□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 HSPA6P17066 643 aa11.79□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 NRAPQ86VF7 1730 aa11.79□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 DLC1Q96QB1 1528 aa11.79□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.78□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 CASZ1Q86V15 1759 aa11.78□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 PTGER2P43116 358 aa11.78□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.78□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.78□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 HFM1A2PYH4 1435 aa11.77□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.77□□□□□ -0.52
SNORD46-201ENST00000364043 PRELPP51888 382 aa11.77□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.76□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.76□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.76□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.76□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 NUTM2FA1L443 756 aa11.75□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 GPR162Q16538 588 aa11.75□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 BTG4Q9NY30 223 aa11.75□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 ABCA3Q99758 1704 aa11.74□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 MAP3K5Q99683 1374 aa11.74□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 DAPK1P53355 1430 aa11.74□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 KIF1AQ12756 1690 aa11.73□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.72□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.72□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.72□□□□□ -0.53
SNORD46-201ENST00000364043 ARHGEF10O15013 1369 aa11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms