RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS1-204ENST00000352260 C3P01024 1663 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS1-204ENST00000352260 EVC2Q86UK5 1308 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS1-204ENST00000352260 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SPNS1-204ENST00000352260 PPP2R1AP30153 589 aa24.79■■□□□ 1.56
SPNS1-204ENST00000352260 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SPNS1-204ENST00000352260 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
SPNS1-204ENST00000352260 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
SPNS1-204ENST00000352260 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.75■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 PRAM1Q96QH2 718 aa24.75■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.74■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 INSRP06213 1382 aa24.73■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 DLC1Q96QB1 1528 aa24.73■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 POGKQ9P215 609 aa24.73■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 CABP2Q9NPB3 220 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.7■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 NLRP1Q9C000 1473 aa24.7■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 USP32Q8NFA0 1604 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 HSPA2P54652 639 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.68■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC11Q96J66 1382 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 METP08581 1390 aa24.65■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 NUDCQ9Y266 331 aa24.65■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.64■■□□□ 1.54
SPNS1-204ENST00000352260 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.63■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.62■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.6■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.6■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 CDK19Q9BWU1 502 aa24.6■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 MORC1Q86VD1 984 aa24.59■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1W2PP64 1363 aa24.59■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.58■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.57■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 TECPR2O15040 1411 aa24.57■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 NSD2O96028 1365 aa24.57■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 LTKP29376 864 aa24.56■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 CPS1P31327 1500 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 SLIT1O75093 1534 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 SIRT1Q96EB6 747 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 PDE3BQ13370 1112 aa24.52■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.52■■□□□ 1.52
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 MED14O60244 1454 aa24.5■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 NBR1Q14596 966 aa24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 EID1Q9Y6B2 187 aa24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 CABP1Q9NZU7 370 aa24.48■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 USP35Q9P2H5 1018 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 ATP7BP35670 1465 aa24.45■■□□□ 1.51
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 SHPRHQ149N8 1683 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 PTPRUQ92729 1446 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 MTHFSP49914 203 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 FYB1O15117 783 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.39■■□□□ 1.5
SPNS1-204ENST00000352260 STRCQ7RTU9 1775 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 TBX22Q9Y458 520 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRB2O60241 1585 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 DIP2AQ14689 1571 aa24.38■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
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