RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323482.8

ACSS1-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS1, Length 3,680 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-201ENST00000323482 CFAP53Q96M91 514 aa20.45■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.44■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 PDE3AQ14432 1141 aa20.44■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.44■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.43■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 SYNJ2O15056 1496 aa20.43■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 A2MP01023 1474 aa20.43■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 AFAP1Q8N556 730 aa20.42■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.41■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 UQCRHP07919 91 aa20.41■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 MTHFSP49914 203 aa20.41■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.4■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.4■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.4■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 STK26Q9P289 416 aa20.4■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 TSC1Q92574 1164 aa20.4■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.4■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.4■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 PLA2R1Q13018 1463 aa20.39■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 IGSF3O75054 1194 aa20.39■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.39■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.39■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 TPM2P07951 284 aa20.35■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.35■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.34■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.34■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.34■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.34■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.33■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACSS1-201ENST00000323482 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.33■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.32■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 KIF3BO15066 747 aa20.32■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 DTNBO60941 627 aa20.32■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.32■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 CBX1P83916 185 aa20.32■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 RUNDC1Q96C34 613 aa20.32■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 SYCE3A1L190 88 aa20.31■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.31■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.31■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.3■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 SOX12O15370 315 aa20.3■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 FSD2A1L4K1 749 aa20.3■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.29■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.29■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.28■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.28■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.28■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.28■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 TRIM27P14373 513 aa20.27■□□□□ 0.84
ACSS1-201ENST00000323482 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.26■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 NUP160Q12769 1436 aa20.26■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 RIPK4P57078 832 aa20.26■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.25■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.25■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.25■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 FBLN1P23142 703 aa20.24■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.24■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.24■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 ABCA8O94911 1581 aa20.24■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.23■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 HMOX1P09601 288 aa20.23■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 PKP1Q13835 747 aa20.23■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.22■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.21■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.21■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.21■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF521Q96K83 1311 aa20.21■□□□□ 0.83
ACSS1-201ENST00000323482 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.2■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.2■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.2■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 RBSNQ9H1K0 784 aa20.19■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 CABP2Q9NPB3 220 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS1-201ENST00000323482 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1254.3 ms