RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 NEUROD2Q15784 382 aa26.69■■□□□ 1.86
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ODC1-201ENST00000234111 SYNMO15061 1565 aa26.67■■□□□ 1.86
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ODC1-201ENST00000234111 NGEFQ8N5V2 710 aa26.66■■□□□ 1.86
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ODC1-201ENST00000234111 MAP7D2Q96T17 732 aa26.62■■□□□ 1.85
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF445P59923 1031 aa26.43■■□□□ 1.82
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ODC1-201ENST00000234111 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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ODC1-201ENST00000234111 MCTP1Q6DN14 999 aa26.39■■□□□ 1.81
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ODC1-201ENST00000234111 ATP10AO60312 1499 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.37■■□□□ 1.81
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ODC1-201ENST00000234111 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 KANK1Q14678 1352 aa26.34■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 AK9Q5TCS8 1911 aa26.33■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 CCDC27Q2M243 656 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-201ENST00000234111 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.32■■□□□ 1.8
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