RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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HOXA11-201ENST00000006015 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 PDE3AQ14432 1141 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 ZMYM3Q14202 1370 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 ERVK-7P63135 1459 aa25.17■■□□□ 1.62
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HOXA11-201ENST00000006015 MYOM1P52179 1685 aa25.15■■□□□ 1.62
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HOXA11-201ENST00000006015 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.12■■□□□ 1.61
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HOXA11-201ENST00000006015 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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HOXA11-201ENST00000006015 ABCC3O15438 1527 aa25.11■■□□□ 1.61
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HOXA11-201ENST00000006015 APAF1O14727 1248 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXA11-201ENST00000006015 NEO1Q92859 1461 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXA11-201ENST00000006015 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXA11-201ENST00000006015 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.05■■□□□ 1.6
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HOXA11-201ENST00000006015 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXA11-201ENST00000006015 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXA11-201ENST00000006015 IDI1Q13907 227 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXA11-201ENST00000006015 MCM4P33991 863 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXA11-201ENST00000006015 COG6Q9Y2V7 657 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXA11-201ENST00000006015 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXA11-201ENST00000006015 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXA11-201ENST00000006015 SLC24A1O60721 1099 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXA11-201ENST00000006015 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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HOXA11-201ENST00000006015 MRE11P49959 708 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXA11-201ENST00000006015 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.97■■□□□ 1.59
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HOXA11-201ENST00000006015 PANK2Q9BZ23 570 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXA11-201ENST00000006015 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
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HOXA11-201ENST00000006015 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 STK26Q9P289 416 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 RICTORQ6R327 1708 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 TRAK2O60296 914 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 MORC1Q86VD1 984 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 WWC1Q8IX03 1113 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 CABP2Q9NPB3 220 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXA11-201ENST00000006015 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 PIK3C2BO00750 1634 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 GLI2P10070 1586 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA11-201ENST00000006015 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
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