RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176304.7

Syne4-208, Transcript of Nesprin-4, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Syne4, Length 1,006 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
Syne4-208ENSMUST00000176304 Slc52a2Q9D8F3 450 aa23.34■■□□□ 1.33
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ggt6Q6PDE7 497 aa23.33■■□□□ 1.33
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cep170bQ80U49 1574 aa23.32■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Q3UJC8 639 aa23.32■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Os9Q8K2C7 672 aa23.32■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa23.32■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Lrp6O88572 1613 aa23.31■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 GnpatP98192 678 aa23.31■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rgl3Q3UYI5 709 aa23.31■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Fan1Q69ZT1 1020 aa23.31■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 MypopQ8R4U1 393 aa23.31■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Siglec1Q62230 1695 aa23.3■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa23.3■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Wnk3Q80XP9 1757 aa23.29■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Lrrc7Q80TE7 1490 aa23.29■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa23.28■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 DccP70211 1447 aa23.27■■□□□ 1.32
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dmrt2Q8BG36 561 aa23.26■■□□□ 1.31
Syne4-208ENSMUST00000176304 Usp47Q8BY87 1376 aa23.26■■□□□ 1.31
Syne4-208ENSMUST00000176304 C5P06684 1680 aa23.25■■□□□ 1.31
Syne4-208ENSMUST00000176304 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
Syne4-208ENSMUST00000176304 Farp2Q91VS8 1065 aa23.24■■□□□ 1.31
Syne4-208ENSMUST00000176304 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kcna6Q61923 529 aa23.23■■□□□ 1.31
Syne4-208ENSMUST00000176304 Als2Q920R0 1651 aa23.22■■□□□ 1.31
Syne4-208ENSMUST00000176304 Eid3Q3V124 375 aa23.2■■□□□ 1.3
Syne4-208ENSMUST00000176304 Gm20521D3Z5F7 333 aa23.19■■□□□ 1.3
Syne4-208ENSMUST00000176304 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Syne4-208ENSMUST00000176304 Sox12Q04890 314 aa23.17■■□□□ 1.3
Syne4-208ENSMUST00000176304 Smim5Q8BT42 78 aa23.17■■□□□ 1.3
Syne4-208ENSMUST00000176304 Plekhg1F6S200 1446 aa23.16■■□□□ 1.3
Syne4-208ENSMUST00000176304 Abca14E9Q8F8 1683 aa23.16■■□□□ 1.3
Syne4-208ENSMUST00000176304 NinlQ6ZQ12 1394 aa23.15■■□□□ 1.3
Syne4-208ENSMUST00000176304 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Syne4-208ENSMUST00000176304 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa23.14■■□□□ 1.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kif1aP33173 1695 aa23.13■■□□□ 1.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Tmem2Q5FWI3 1383 aa23.13■■□□□ 1.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Abcc10Q8R4P9 1501 aa23.13■■□□□ 1.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Idi1P58044 227 aa23.12■■□□□ 1.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Camta1A2A891 1682 aa23.11■■□□□ 1.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Mier1Q5UAK0 511 aa23.09■■□□□ 1.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa23.09■■□□□ 1.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Mink1Q9JM52 1308 aa23.08■■□□□ 1.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Tex14Q7M6U3 1450 aa23.07■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 Zranb1Q7M760 708 aa23.07■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 Stag3O70576 1240 aa23.06■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 IqubQ8CDK3 788 aa23.06■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 NgefQ8CHT1 710 aa23.06■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 Acsbg1Q99PU5 721 aa23.06■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 Emilin2Q8K482 1074 aa23.05■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 Fam135bQ9DAI6 1403 aa23.05■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 Atp7bQ64446 1462 aa23.04■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa23.03■■□□□ 1.28
Syne4-208ENSMUST00000176304 MpndQ3TV65 487 aa23.01■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Usp40Q8BWR4 1235 aa23.01■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Neurod1Q60867 357 aa22.99■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Eno4Q8C042 619 aa22.99■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Znf316Q6PGE4 1016 aa22.98■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ap3b2Q9JME5 1082 aa22.98■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Wdr17E9Q271 1322 aa22.98■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Atp10bB1AWN4 1474 aa22.98■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 PtpruB1AUH1 1446 aa22.97■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Abca15E9PWH4 1668 aa22.94■■□□□ 1.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cadps2Q8BYR5 1297 aa22.93■■□□□ 1.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Polr3aB2RXC6 1390 aa22.91■■□□□ 1.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rgs17Q9QZB0 210 aa22.91■■□□□ 1.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Slc35g1Q8BY79 368 aa22.9■■□□□ 1.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Nphp4P59240 1425 aa22.9■■□□□ 1.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cdk19Q8BWD8 501 aa22.89■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Sirt1Q923E4 737 aa22.89■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Mon2Q80TL7 1715 aa22.88■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Nrxn1Q9CS84 1514 aa22.88■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa22.88■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 NktrP30415 1453 aa22.87■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dixdc1Q80Y83 711 aa22.87■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Zbtb4Q5F293 982 aa22.86■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 InhbeO08717 350 aa22.85■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Fyb1O35601 819 aa22.85■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa22.85■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Psrc1Q9D0P7 329 aa22.85■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Mug2P28666 1451 aa22.84■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ildr2B5TVM2 661 aa22.83■■□□□ 1.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Syne4-208ENSMUST00000176304 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa22.8■■□□□ 1.24
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa22.8■■□□□ 1.24
Syne4-208ENSMUST00000176304 Txnrd1Q9JMH6 613 aa22.79■■□□□ 1.24
Syne4-208ENSMUST00000176304 CenpjQ569L8 1344 aa22.79■■□□□ 1.24
Syne4-208ENSMUST00000176304 Col16a1Q8BLX7 1580 aa22.78■■□□□ 1.24
Syne4-208ENSMUST00000176304 Col22a1E9Q7P1 1613 aa22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.5 ms