RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000120539.7

Lmo4-201, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmo4, Length 1,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa33.38■■■□□ 2.93
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tns3Q5SSZ5 1440 aa33.35■■■□□ 2.93
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa33.3■■■□□ 2.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa33.3■■■□□ 2.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gli3Q61602 1583 aa33.3■■■□□ 2.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mink1Q9JM52 1308 aa33.3■■■□□ 2.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 CenpjQ569L8 1344 aa33.29■■■□□ 2.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa33.27■■■□□ 2.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Col18a1P39061 1774 aa33.24■■■□□ 2.91
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NktrP30415 1453 aa33.23■■■□□ 2.91
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Col14a1Q80X19 1797 aa33.22■■■□□ 2.91
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa33.22■■■□□ 2.91
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tmem94Q7TSH8 1360 aa33.21■■■□□ 2.91
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NalcnQ8BXR5 1738 aa33.21■■■□□ 2.91
Lmo4-201ENSMUST00000120539 InsrP15208 1372 aa33.2■■■□□ 2.91
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Q3UJC8 639 aa33.2■■■□□ 2.9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 ClspnQ80YR7 1315 aa33.2■■■□□ 2.9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Plekhg5Q66T02 1073 aa33.17■■■□□ 2.9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 C5P06684 1680 aa33.15■■■□□ 2.9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 C3P01027 1663 aa33.15■■■□□ 2.9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Als2Q920R0 1651 aa33.13■■■□□ 2.89
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cdk19Q8BWD8 501 aa33.13■■■□□ 2.89
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sbno1Q689Z5 1390 aa33.12■■■□□ 2.89
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slc24a1Q91WD8 1130 aa33.1■■■□□ 2.89
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slain2Q8CI08 581 aa33.08■■■□□ 2.89
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gsto1O09131 240 aa33.07■■■□□ 2.88
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm10563F6WIE4 79 aa33.06■■■□□ 2.88
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zranb1Q7M760 708 aa33.03■■■□□ 2.88
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Amigo3Q8C2S7 508 aa33.03■■■□□ 2.88
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa33.01■■■□□ 2.88
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slc4a1apE9PX68 744 aa33.01■■■□□ 2.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sall2Q9QX96 1004 aa33.01■■■□□ 2.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PrxO55103 1391 aa33■■■□□ 2.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Evi5lH3BKQ3 813 aa33■■■□□ 2.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sirt1Q923E4 737 aa33■■■□□ 2.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa32.98■■■□□ 2.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cnga1P29974 684 aa32.97■■■□□ 2.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abcc10Q8R4P9 1501 aa32.97■■■□□ 2.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 FanciQ8K368 1330 aa32.97■■■□□ 2.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Iqsec2Q5DU25 1478 aa32.93■■■□□ 2.86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pank3Q8R2W9 370 aa32.93■■■□□ 2.86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fam184bQ0KK56 942 aa32.92■■■□□ 2.86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tmf1B9EKI3 1091 aa32.91■■■□□ 2.86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PtpruB1AUH1 1446 aa32.9■■■□□ 2.86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Idi1P58044 227 aa32.89■■■□□ 2.86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mon2Q80TL7 1715 aa32.89■■■□□ 2.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Znf316Q6PGE4 1016 aa32.88■■■□□ 2.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Map3k19E9Q3S4 1311 aa32.88■■■□□ 2.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Adgrl1Q80TR1 1466 aa32.87■■■□□ 2.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Idi2Q8BFZ6 227 aa32.85■■■□□ 2.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Inpp5dQ9ES52 1191 aa32.85■■■□□ 2.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Wnk3Q80XP9 1757 aa32.85■■■□□ 2.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Brinp3Q499E0 766 aa32.85■■■□□ 2.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nrxn1Q9CS84 1514 aa32.84■■■□□ 2.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atf3Q60765 181 aa32.82■■■□□ 2.84
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sox12Q04890 314 aa32.81■■■□□ 2.84
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tmem2Q5FWI3 1383 aa32.8■■■□□ 2.84
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Camta1A2A891 1682 aa32.78■■■□□ 2.84
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zscan10Q3URR7 782 aa32.78■■■□□ 2.84
Lmo4-201ENSMUST00000120539 CatipB9EKE5 520 aa32.76■■■□□ 2.84
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NgefQ8CHT1 710 aa32.75■■■□□ 2.83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ap3b2Q9JME5 1082 aa32.75■■■□□ 2.83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NinlQ6ZQ12 1394 aa32.71■■■□□ 2.83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kcna6Q61923 529 aa32.69■■■□□ 2.82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif1aP33173 1695 aa32.69■■■□□ 2.82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Znf335A2A5K6 1337 aa32.65■■■□□ 2.82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa32.65■■■□□ 2.82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Farp2Q91VS8 1065 aa32.64■■■□□ 2.82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa32.62■■■□□ 2.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 DccP70211 1447 aa32.62■■■□□ 2.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dcaf11Q91VU6 549 aa32.62■■■□□ 2.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 KdrP35918 1367 aa32.61■■■□□ 2.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif16bB1AVY7 1312 aa32.6■■■□□ 2.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 GnpatP98192 678 aa32.59■■■□□ 2.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Hspa1lP16627 641 aa32.58■■■□□ 2.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pik3c2aQ61194 1686 aa32.57■■■□□ 2.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Wdr17E9Q271 1322 aa32.57■■■□□ 2.8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Bcl11bQ99PV8 884 aa32.57■■■□□ 2.8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif7B7ZNG0 1348 aa32.56■■■□□ 2.8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slc35g1Q8BY79 368 aa32.53■■■□□ 2.8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Col16a1Q8BLX7 1580 aa32.5■■■□□ 2.79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa32.49■■■□□ 2.79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gimap5Q8BWF2 308 aa32.49■■■□□ 2.79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Astn2Q80Z10 1352 aa32.48■■■□□ 2.79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif24Q6NWW5 1356 aa32.47■■■□□ 2.79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ttll13A4Q9F6 804 aa32.46■■■□□ 2.79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mdc1Q5PSV9 1707 aa32.45■■■□□ 2.78
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fyb1O35601 819 aa32.44■■■□□ 2.78
Lmo4-201ENSMUST00000120539 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ubr1O70481 1757 aa32.4■■■□□ 2.78
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.9 ms