Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55.87■■■■■ 6.53
Tns3Q5SSZ5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
Tns3Q5SSZ5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
Tns3Q5SSZ5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.8■■■■■ 5.4
Tns3Q5SSZ5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
Tns3Q5SSZ5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
Tns3Q5SSZ5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47.12■■■■■ 5.13
Tns3Q5SSZ5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
Tns3Q5SSZ5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Tns3Q5SSZ5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
Tns3Q5SSZ5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
Tns3Q5SSZ5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
Tns3Q5SSZ5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
Tns3Q5SSZ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45.25■■■■■ 4.83
Tns3Q5SSZ5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Tns3Q5SSZ5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Tns3Q5SSZ5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Tns3Q5SSZ5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Tns3Q5SSZ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Tns3Q5SSZ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Tns3Q5SSZ5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
Tns3Q5SSZ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
Tns3Q5SSZ5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Tns3Q5SSZ5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Tns3Q5SSZ5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Tns3Q5SSZ5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Tns3Q5SSZ5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Tns3Q5SSZ5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Tns3Q5SSZ5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
Tns3Q5SSZ5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Tns3Q5SSZ5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
Tns3Q5SSZ5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Tns3Q5SSZ5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Tns3Q5SSZ5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Tns3Q5SSZ5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Tns3Q5SSZ5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
Tns3Q5SSZ5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Tns3Q5SSZ5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Tns3Q5SSZ5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
Tns3Q5SSZ5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
Tns3Q5SSZ5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Tns3Q5SSZ5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
Tns3Q5SSZ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
Tns3Q5SSZ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Tns3Q5SSZ5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Tns3Q5SSZ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Tns3Q5SSZ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
Tns3Q5SSZ5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Tns3Q5SSZ5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
Tns3Q5SSZ5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Tns3Q5SSZ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
Tns3Q5SSZ5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Tns3Q5SSZ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Tns3Q5SSZ5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Tns3Q5SSZ5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Tns3Q5SSZ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Tns3Q5SSZ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Tns3Q5SSZ5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Tns3Q5SSZ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Tns3Q5SSZ5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Tns3Q5SSZ5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Tns3Q5SSZ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Tns3Q5SSZ5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Tns3Q5SSZ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Tns3Q5SSZ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Tns3Q5SSZ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Tns3Q5SSZ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Tns3Q5SSZ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Tns3Q5SSZ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Tns3Q5SSZ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Tns3Q5SSZ5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Tns3Q5SSZ5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Tns3Q5SSZ5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
Tns3Q5SSZ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Tns3Q5SSZ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Tns3Q5SSZ5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Tns3Q5SSZ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Tns3Q5SSZ5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Tns3Q5SSZ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Tns3Q5SSZ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Tns3Q5SSZ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Tns3Q5SSZ5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Tns3Q5SSZ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Tns3Q5SSZ5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Tns3Q5SSZ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Tns3Q5SSZ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Tns3Q5SSZ5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Tns3Q5SSZ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Tns3Q5SSZ5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Tns3Q5SSZ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Tns3Q5SSZ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Tns3Q5SSZ5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Tns3Q5SSZ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Tns3Q5SSZ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Tns3Q5SSZ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Tns3Q5SSZ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Tns3Q5SSZ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Tns3Q5SSZ5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms