Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z10

Astn2, Astrotactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn2Q80Z10 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52.52■■■■■ 6
Astn2Q80Z10 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
Astn2Q80Z10 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
Astn2Q80Z10 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
Astn2Q80Z10 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
Astn2Q80Z10 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
Astn2Q80Z10 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Astn2Q80Z10 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Astn2Q80Z10 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Astn2Q80Z10 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Astn2Q80Z10 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
Astn2Q80Z10 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Astn2Q80Z10 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Astn2Q80Z10 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Astn2Q80Z10 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Astn2Q80Z10 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
Astn2Q80Z10 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Astn2Q80Z10 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Astn2Q80Z10 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Astn2Q80Z10 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Astn2Q80Z10 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Astn2Q80Z10 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Astn2Q80Z10 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
Astn2Q80Z10 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Astn2Q80Z10 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Astn2Q80Z10 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Astn2Q80Z10 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Astn2Q80Z10 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Astn2Q80Z10 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Astn2Q80Z10 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Astn2Q80Z10 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
Astn2Q80Z10 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Astn2Q80Z10 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Astn2Q80Z10 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Astn2Q80Z10 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Astn2Q80Z10 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Astn2Q80Z10 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
Astn2Q80Z10 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Astn2Q80Z10 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Astn2Q80Z10 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Astn2Q80Z10 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Astn2Q80Z10 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Astn2Q80Z10 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Astn2Q80Z10 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Astn2Q80Z10 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Astn2Q80Z10 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Astn2Q80Z10 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Astn2Q80Z10 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Astn2Q80Z10 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Astn2Q80Z10 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Astn2Q80Z10 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Astn2Q80Z10 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Astn2Q80Z10 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Astn2Q80Z10 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Astn2Q80Z10 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Astn2Q80Z10 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Astn2Q80Z10 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Astn2Q80Z10 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Astn2Q80Z10 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
Astn2Q80Z10 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Astn2Q80Z10 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Astn2Q80Z10 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Astn2Q80Z10 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Astn2Q80Z10 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Astn2Q80Z10 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Astn2Q80Z10 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Astn2Q80Z10 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Astn2Q80Z10 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Astn2Q80Z10 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Astn2Q80Z10 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Astn2Q80Z10 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Astn2Q80Z10 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Astn2Q80Z10 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Astn2Q80Z10 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Astn2Q80Z10 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Astn2Q80Z10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Astn2Q80Z10 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Astn2Q80Z10 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Astn2Q80Z10 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Astn2Q80Z10 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Astn2Q80Z10 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Astn2Q80Z10 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Astn2Q80Z10 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Astn2Q80Z10 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Astn2Q80Z10 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Astn2Q80Z10 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Astn2Q80Z10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Astn2Q80Z10 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Astn2Q80Z10 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Astn2Q80Z10 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Astn2Q80Z10 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Astn2Q80Z10 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Astn2Q80Z10 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Astn2Q80Z10 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Astn2Q80Z10 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Astn2Q80Z10 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Astn2Q80Z10 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Astn2Q80Z10 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Astn2Q80Z10 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Astn2Q80Z10 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms