RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C Q0297Q9ZZV8 51 aa-0.05□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C ROX3P25046 220 aa-0.06□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C YFR009W-AP0C5M9 85 aa-0.06□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C UBC5P15732 148 aa-0.06□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C YOR343CQ12484 108 aa-0.06□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C MEC1P38111 2368 aa-0.07□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C YBL071CP38185 102 aa-0.07□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C IRA1P18963 3092 aa-0.07□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C AIM19P40502 157 aa-0.08□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C MIX14Q04341 121 aa-0.08□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C RSM19P53733 91 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C Q0017Q9ZZX8 53 aa-0.08□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C PAU1P0CE88 120 aa-0.09□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C PAU14P0CE89 120 aa-0.09□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C PAU8P0CE92 120 aa-0.09□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C PAU11P0CE93 120 aa-0.09□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C PAU13P38725 120 aa-0.09□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C RPS12P48589 143 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C PAU10Q03050 120 aa-0.09□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C PAU9Q3E770 120 aa-0.09□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C YBR090CP38253 122 aa-0.1□□□□□ -2.42
HDA3YPR179C YJR107C-AP0CT86 78 aa-0.1□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C YHL005CP38752 130 aa-0.11□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C YER137CP40083 148 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C RPL38P49167 78 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C SGF11Q03067 99 aa-0.11□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C KSH1Q8TGJ3 72 aa-0.12□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C YOR032W-AQ8TGS1 66 aa-0.12□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C IRA2P19158 3079 aa-0.12□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C SPC1P46965 94 aa-0.12□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C PAU4P53427 120 aa-0.12□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C NHP10Q03435 203 aa-0.12□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C YMR082CQ04276 118 aa-0.13□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C YIL134C-AQ45U18 67 aa-0.13□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C HMRA1P0CY11 126 aa-0.14□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C EMC5P40540 141 aa-0.14□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C YHR050W-AQ05451 56 aa-0.14□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C PDX3P38075 228 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa-0.14□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C COX7P10174 60 aa-0.15□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C Q0032Q9ZZX7 96 aa-0.15□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C RGI1P40043 161 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C YML054C-AQ3E809 52 aa-0.15□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C BPH1P25356 2167 aa-0.16□□□□□ -2.43
HDA3YPR179C YDR034C-AP0C289 58 aa-0.16□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YFR010W-AP0C5N0 62 aa-0.16□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C RRT15Q3E811 62 aa-0.16□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C TOM1Q03280 3268 aa-0.16□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C HOR7Q05827 59 aa-0.17□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa-0.17□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YCR075W-AQ3E830 75 aa-0.17□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YPR010C-AA5Z2X5 72 aa-0.18□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YOR192C-CQ3E736 78 aa-0.18□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C CSF1Q12150 2958 aa-0.19□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YHR214C-DP0CX93 97 aa-0.19□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C SNU13P39990 126 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YDR029WQ12111 104 aa-0.19□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C VPS13Q07878 3144 aa-0.2□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa-0.2□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C TOM6P33448 61 aa-0.21□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C SIP18P50263 79 aa-0.21□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YHR073W-AP0C5N7 58 aa-0.21□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C BSC4P53841 131 aa-0.21□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C TOM7P53507 60 aa-0.22□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YCR108CQ3E819 63 aa-0.22□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C YOR072W-BQ3E832 53 aa-0.22□□□□□ -2.44
HDA3YPR179C ECM12O13529 151 aa-0.23□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C MSL1P40567 111 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C ERI1P62651 68 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YDR381C-AQ3E6R5 114 aa-0.23□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YMR122W-AQ3E842 84 aa-0.23□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C RPS27AP35997 82 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C RPS27BP38711 82 aa-0.24□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C FYV7Q12247 151 aa-0.24□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C COA2Q3E823 68 aa-0.24□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YAL065CO13511 128 aa-0.25□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C SDH6Q3E785 79 aa-0.25□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YBL044WP38194 122 aa-0.25□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YGR025WP53216 100 aa-0.25□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C ATP18P81450 59 aa-0.25□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C PMP3P87284 55 aa-0.25□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YDR042CQ03205 200 aa-0.25□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YGR121W-AQ3E816 71 aa-0.26□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C SUS1Q6WNK7 96 aa-0.26□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C RPL39P04650 51 aa-0.26□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C MHF2Q3E829 80 aa-0.26□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C TRA1P38811 3744 aa-0.27□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YDR119W-AQ2V2P9 66 aa-0.27□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YLR157W-DP0CE99 70 aa-0.28□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YGL258W-AQ3E740 77 aa-0.28□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C FPR2P32472 135 aa-0.28□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C CWP2P43497 92 aa-0.28□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C EDC1P53080 175 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C YMR001C-AQ8TGS9 76 aa-0.28□□□□□ -2.45
HDA3YPR179C RPL29P05747 59 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
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